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Enregistrement W4393010344 · doi:10.21203/rs.3.rs-4000880/v1

Impact of long-term storage on mid-infrared spectral patterns of serum and synovial fluid samples of dogs with osteoarthritis

2024· preprint· en· W4393010344 sur OpenAlexaff
Sarah Malek, Federico Marini, J. Trenton McClure

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfrared Thermography in Medicine
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteoarthritisSynovial fluidTerm (time)InfraredMedicinePathologyPhysicsOpticsAstronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The aim of this study was to evaluate the impact of short versus long-term storage on mid-infrared (MIR) spectral patterns of serum and synovial fluid (SF) of dogs with knee osteoarthritis (OA) and controls. Serum (52 OA and 49 control) and SF (51 OA and 51 control) samples from dogs that had been in short-term (<3 years) frozen state (-80°C) had their MIR spectra obtained. The remaining aliquots were maintained in long-term (>5 years) frozen state before having MIR spectra acquired under the same testing conditions. Spectra from the two time points were significantly different (P<0.0001), however, sample aging accounted for only 1.61% and 2.98% of serum and SF profiles’ variability, respectively. Predictive models for discriminating serum of OA from controls for short-term storage showed 87.3±3.7% sensitivity, 88.9±2.4% specificity and 88.1±2.3% accuracy, while, for long-term storage, values of the same figures of merit were 92.5±2.6%, 97.1±1.7% and 94.8±1.4%, respectively. Predictive models based on short-term stored SF spectra had 97.3±1.6% sensitivity, 89.4±2.6% specificity and 93.4±1.6% accuracy, while the values for long-term storage 95.7±2.1%, 95.7±0.8% and 95.8±1.1%, respectively. Long-term storage of serum and does not significantly alter the performance of predictive algorithms for discriminating OA samples from controls.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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