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Enregistrement W4393073073 · doi:10.1158/1538-7445.am2024-7061

Abstract 7061: Targeting metabolic vulnerabilities in ARID1A/B dual-deficient dedifferentiated endometrial carcinoma

2024· article· en· W4393073073 sur OpenAlexaff
Rebecca Ho, Eunice Li, Chae Young Shin, Shary Chen, David G. Huntsman, Yemin Wang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensSpinal Cord Injury BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésARID1AMedicineEndometrial cancerCancer researchCarcinomaOncologyInternal medicineBiologyCancerGeneGeneticsMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Dedifferentiated endometrial carcinoma (DDEC) is an aggressive endometrial carcinoma defined histologically by undifferentiated carcinoma juxtaposed against stage 1 or 2 endometrial adenocarcinoma. DDEC responds poorly to conventional platinum/taxane-based chemotherapy, particularly in the case of extrauterine spread. This highlights a need to develop novel therapies for individuals with DDEC. Genetically, a third of DDEC cases have co-inactivating mutations of ARID1A and ARID1B. These genes encode core subunits of the sucrose/switch non-fermentable (SWI/SNF) complex that regulate transcription. Furthermore, dual loss of ARID1A/B is believed to play a role in driving DDEC tumor development. We hypothesize that ARID1A/B dual-deficiency in DDEC generates unique genetic deficiencies that allow for the development of novel therapies for this cancer. We approached this hypothesis by first conducting a preliminary analysis of the Cancer Dependency Map (DepMap), which has identified vulnerabilities in mitochondrial functioning in ARID1A/B dual-deficient DDECs. As such, we aimed to understand the role of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) and redox homeostasis in ARID1A/B dual-deficient DDEC to create new treatment options. Methods: A panel of ARID1A/B dual-deficient and proficient endometrial cancer cell lines were treated with OXPHOS inhibitor IACS-010759 and reactive oxidative species (ROS)-inducing agent elesclomol to identify shifts in drug response between the two groups. To account for genomic differences between the cell lines, we also treated an ARID1B knock-out isogeneic cell line with the drugs. Additionally, changes in metabolism in the endometrial cancer cell lines were measured using Seahorse metabolic flux assays to determine if ARID1A/B dual-deficient cell lines have an increased dependency on OXPHOS for cell growth. Results: While the Seahorse assays revealed no significant difference in OXPHOS and glycolysis activities between the two groups, drug sensitivity assays demonstrated that ARID1A/B dual-deficient cancers are more sensitive to OXPHOS inhibition and increased ROS production than the proficient cell lines. Depletion of ARID1B in an ARID1A deficient cell line sensitizes the cells to both drugs. Furthermore, IACS-010759 significantly suppressed the growth of ARID1A/B-deficient DDEC xenograft tumor growth. Conclusion: ARID1A/B-dual deficient cancer cells rely on mitochondria function for survival. The underlying mechanisms are currently under investigation. Citation Format: Rebecca Ho, Eunice Li, Chae Young Shin, Shary Chen, David Huntsman, Yemin Wang. Targeting metabolic vulnerabilities in ARID1A/B dual-deficient dedifferentiated endometrial carcinoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 1 (Regular Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(6_Suppl):Abstract nr 7061.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,595

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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