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Enregistrement W4393156617 · doi:10.1101/2024.03.23.586386

Structural insights into the agonist selectivity and structure-based engineering of the adenosine A3 receptor

2024· preprint· en· W4393156617 sur OpenAlexaff
Hidetaka S. Oshima, Akiko Ogawa, Fumiya K. Sano, Hiroaki Akasaka, Tomoyoshi Kawakami, Hiroyuki H. Okaomto, A. Iwama, Chisae Nagiri, Fan‐Yan Wei, Wataru Shihoya, Osamu Nureki

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesExploratory Research for Advanced TechnologyJapan Society for the Promotion of ScienceOno Medical Research FoundationKao Foundation for Arts and SciencesJapan Agency for Medical Research and DevelopmentUehara Memorial Foundation
Mots-clésAgonistAdenosine receptorAdenosineChemistryReceptorFunctional selectivitySelectivityPharmacologyNeuroscienceBiophysicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adenosine receptors, expressed across various tissues, play pivotal roles in physiological processes and are implicated in diverse diseases, including neurological disorders and inflammation, highlighting the therapeutic potential of receptor-selective agents. The Adenosine A3 receptor (A 3 R), the last identified adenosine receptor, is also activated by breakdown products of post-transcriptionally modified tRNA and exhibits dual roles in neuron, heart, and immune cells, and is often overexpressed in tumors, making it a target for anticancer therapy. Despite extensive studies on the other adenosine receptors, the structure and activation mechanism of A 3 R, especially by selective agonists like N 6 -methyladenosine (m 6 A) and namodenoson, remained elusive. Here, we identified N 6 -isopentenyl adenosine (i 6 A), a novel A 3 R-selective ligand, via comprehensive modified adenosine library screening. Cryo-EM analyses of A 3 R-G i signaling complexes with two nonselective and three selective agonists revealed the structural basis for A 3 R activation. We further conducted structure-guided engineering of m 6 A-insensitive A 3 R, which would greatly facilitate future discoveries of the physiological functions of the selective activation of A 3 R by modified adenosines. Our results clarify the selective activation of adenosine receptors, providing the basis for future drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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