Abstract 2212 An amphipathic helix drives interaction of Fibrillins with plastoglobule lipid droplets
Notice bibliographique
Résumé
Plastoglobule lipid droplets of chloroplasts serve complex roles affecting plant development, stress tolerance and photosynthesis. They harbor a set of approximately 42 proteins that collectively dictate plastoglobule functions. Due to the monolayer structure of plastoglobules which encompass a neutral lipid core, these proteins must associate monotopically on the plastoglobule surface. However, targeting determinants have not been identified for plastoglobule proteins, and the protein-membrane interaction mechanisms that establish the plastoglobule proteome remain unclear. Here, we demonstrate that plastoglobule-localized Fibrillins (FBNs) harbor an amphipathic helix at the lip of their β-barrel that is necessary for proper plastoglobule association. Molecular dynamics simulations support the specific interaction of the amphipathic helix of Arabidopsis thaliana FBN1a with membranes rich in lipid packing defects which are expected to be especially prevalent on the tightly curved surface of plastoglobules. Introduction of one of the amphipathic helices into stromal- or thylakoid-localized FBNs was ineffective at redirecting the proteins to plastoglobules, likely due to endogenous protein-protein interactions that override the influence of the amphipathic helix. Proteomic analyses indicate AtFBN1a influences the plastoglobule proteome through outcompeting and recruiting specific proteins. We also demonstrate that the plastoglobule-localized FBNs, AtFBN1a and AtFBN7a, bind unsaturated fatty acids, particularly C18:1, and that elimination of the amphipathic helix suppresses fatty acid binding in AtFBN1a, but promotes fatty acid binding in AtFBN7a. Predicted amphipathic helices can be identified on two-thirds of plastoglobule proteins, indicating the use of amphipathic helices may be a general mechanism by which proteins selectively associate with plastoglobules. This work was supported by a grant from the National Science Foundation (MCB-2034631) to P.K.L. This work used Delta at NCSA through allocation BIO210061 from the Advanced Cyberinfrastructure Coordination Ecosystem Services & Supported (ACCESS) program, which is supported by National Science Foundation grants #2138259, #2138286. #2138307, #2137603, and #2138296.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».