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Enregistrement W4393167917 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106510

Abstract 2440 Regulation of the Mitochondrial Pyruvate Carrier by the Wnt/beta-catenin pathway

2024· article· en· W4393167917 sur OpenAlexaff
Luis Cedeño-Rosario, Nimo M. Abdi, Alex J. Bott, Joshua Youngs, Jared Rutter

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBeta-cateninBETA (programming language)ChemistryCateninMitochondrionWnt signaling pathwayBiochemistryComputer scienceSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolism is one of the most tightly regulated cellular processes important for the maintenance of homeostasis. The mitochondrial pyruvate carrier (MPC) is a transmembrane protein that resides in the inner mitochondria membrane and facilitates the entry of pyruvate, which is necessary in several metabolic reactions such as TCA cycle. Our lab has previously shown that MPC expression is negatively correlated with Wnt/β-catenin target genes; however, the molecular mechanism behind the regulation of the MPC by the Wnt/β-catenin signaling pathway is not known. Based on our preliminary observations, we hypothesize that β-catenin acts as a repressor of the MPC. To investigate this regulation, we first performed a Fluorescence-activated cell sorting (FACS)-based genetic screening assay in liver cancer cells and found that β-catenin acts as a genetic repressor of the MPC. Furthermore, we treated liver cancer cells for 48h with GSK3 inhibitors (CHIR99021 or LY2090314) to activate the Wnt/β-catenin pathway, and MPC protein was analyzed by western blot. Interestingly, we found that MPC protein was reduced in cells treated with CHIR99021 or LY2090314 when compared to untreated cells. To investigate whether MPC expression was affected at the transcriptional level, we performed RT-qPCR and found that MPC1 and MPC2 transcripts were decreased in liver cancer cells treated with CHIR99021 or LY2090314. Overall, our results suggest that activation of β-catenin results in decreased MPC transcripts and protein levels. Taken together, we proposed a model where β-catenin acts as a repressor of the MPC in liver cancer cells. Future studies will be focus on characterizing the mechanism by which MPC expression is regulated by the Wnt/β-catenin pathway and the significance of this regulation in cell metabolism and cell fate. This work was supported by the National Institutes of Health (NIH) (to J.R.), the Howard Hughes Medical Institute (HHMI) (to J.R.) and the Burroughs Wellcome Fund (BWF) (to L.C.R).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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