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Enregistrement W4393304858 · doi:10.1101/2024.03.29.587321

Proteome dynamics reveal Leiomodin 1 as a key regulator of myogenic differentiation

2024· preprint· en· W4393304858 sur OpenAlexaff
Ellen Späth, Svenja C. Schüler, Ivonne Heinze, Therese Dau, Alberto E. Minetti, Maleen Hofmann, Julia von Maltzahn, Alessandro Ori‬‬

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesLeibniz-GemeinschaftDeutsche KrebshilfeElse Kröner-Fresenius-StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftAustralian GovernmentCarl-Zeiss-Stiftung
Mots-clésSirtuinCell biologySirtuin 1ChemistryBusinessBiologyBiochemistryGeneDownregulation and upregulationAcetylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During myogenic differentiation the cellular architecture and proteome of muscle stem cells and myoblasts undergo extensive remodeling. These molecular processes are only partially understood and display alterations in disease conditions as well as during aging resulting in impaired regeneration. Here, we used mass spectrometry to quantify the temporal dynamics of more than 6000 proteins during myogenic differentiation. We identified the actin nucleator leiomodin 1 (LMOD1) among a restricted subset of cytoskeletal proteins increasing in abundance in early phases of myogenic differentiation. We show that LMOD1 is already expressed by muscle stem cells in vivo and displays increased abundance during skeletal muscle regeneration, especially during early regeneration suggesting that LMOD1 is important for induction of myotube formation. Of note, knockdown of LMOD1 in primary myoblasts and during skeletal muscle regeneration severely affects myogenic differentiation, while overexpression accelerates and improves the initiation of myotube formation suggesting that LMOD1 is a critical component regulating myogenic differentiation. Mechanistically, we show that LMOD1 physically and functionally interacts with the deacetylase sirtuin1 (SIRT1), a regulator of myogenic differentiation, especially at the onset of myogenic differentiation. We demonstrate that LMOD1 influences SIRT1 localization and the expression of a subset of its target genes. Consistently, depletion or pharmacological inhibition of SIRT1 partially rescues the impairment of myogenic differentiation observed after knockdown of LMOD1. Our work identifies a new regulator of myogenic differentiation that might be targeted to improve muscle regeneration in aging and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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