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Enregistrement W4393386550 · doi:10.1084/jem.20231044

Helper T cell immunity in humans with inherited CD4 deficiency

2024· article· en· W4393386550 sur OpenAlexaff
Antoine Guérin, Marcela Moncada‐Vélez, Katherine Jackson, Masato Ogishi, Jérémie Rosain, Mathieu Mancini, David Langlais, Andrea C. Nunez, Samantha Webster, Jesse Goyette, Taushif Khan, Nico Marr, Danielle T. Avery, Geetha Rao, Tim Waterboer, Birgitta E. Michels, Esmeralda Neves, Cátia Iracema Morais, Jonathan London, S. Mestrallet, Pierre Quartier, Bénédicte Neven, Franck Rapaport, Yoann Seeleuthner, Atar Lev, Amos J. Simon, Jorge Montoya, Ortal Barel, Julio Gómez‐Rodríguez, Julio C. Orrego, Anne-Sophie L’Honneur, Camille Soudée, Jessica Lineth Rojas, Alejandra Vélez, Irini Sereti, Benjamin Terrier, Nancy D. Marín, Luis F. García, Laurent Abel, Stéphanie Boisson‐Dupuis, Joel Reis, António Marinho, Andrea Lisco, Emília Faria, Christopher C. Goodnow, Julia Vasconcelos, Vivien Béziat, S. Cindy, Raz Somech, Jean‐Laurent Casanova, Jacinta Bustamante, José Luis Franco, Stuart G. Tangye

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilAgence Nationale de la RechercheFondation Bettencourt SchuellerInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleInstitut National Du CancerUniversity of New South WalesHonjo International Scholarship FoundationRockefeller UniversityNational Health and Medical Research CouncilInstitut des maladies génétiques ImagineBaxaltaAmerican Association of ImmunologistsSt. Giles Foundation
Mots-clésCD8BiologyImmunityImmunologyImmune systemHuman leukocyte antigenCellular immunityAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD4+ T cells are vital for host defense and immune regulation. However, the fundamental role of CD4 itself remains enigmatic. We report seven patients aged 5-61 years from five families of four ancestries with autosomal recessive CD4 deficiency and a range of infections, including recalcitrant warts and Whipple's disease. All patients are homozygous for rare deleterious CD4 variants impacting expression of the canonical CD4 isoform. A shorter expressed isoform that interacts with LCK, but not HLA class II, is affected by only one variant. All patients lack CD4+ T cells and have increased numbers of TCRαβ+CD4-CD8- T cells, which phenotypically and transcriptionally resemble conventional Th cells. Finally, patient CD4-CD8- αβ T cells exhibit intact responses to HLA class II-restricted antigens and promote B cell differentiation in vitro. Thus, compensatory development of Th cells enables patients with inherited CD4 deficiency to acquire effective cellular and humoral immunity against an unexpectedly large range of pathogens. Nevertheless, CD4 is indispensable for protective immunity against at least human papillomaviruses and Trophyrema whipplei.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,293
Score d'incertitude au seuil0,888

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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