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Enregistrement W4393408837 · doi:10.1117/12.3006650

CNN-derived brain age gaps of different neurological and cardiovascular diseases in the UK Biobank and identifying affected brain regions

2024· article· en· W4393408837 sur OpenAlexaff
Elizabeth McAvoy, Matthias Wilms, Nils D. Forkert

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensOntario Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortBiobankMedicineBiomarkerNeuroimagingDiseaseCohort studyPhysical medicine and rehabilitationInternal medicineBioinformaticsPsychiatryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The difference between chronological age and predicted biological brain age, the so-called “brain age gap”, is a promising biomarker for assessment of overall brain health. It has also been suggested as a biomarker for early detection of neurological and cardiovascular conditions. The aim of this work is to identify group-level variability in the brain age gap between healthy subjects and patients with neurological and cardiovascular diseases. Therefore, a deep convolutional neural network was trained on UK Biobank T1-weighted-MRI datasets of healthy subjects (n=6860) to predict brain age. After training, the model was used to determine the brain age gap for healthy hold-out test subjects (n=344), and subjects with neurological (n=2327) or cardiovascular (n=6467) diseases. Next, saliency maps were analyzed to identify brain regions used by the model to render decisions. Linear bias correction was implemented to correct for the bias of age predictions made by the model. The trained model after bias correction achieved an average brain age gap of 0.05 years for the healthy test cohort while the neurological disease test cohort had an average brain age gap of 0.7 years, and the cardiovascular disease test cohort had an average brain age gap of 0.25 years. The average saliency maps appear similar for the three test group, suggesting that the model mostly uses brain areas associated with general brain aging patterns. This works results indicate potential in the brain age gap for differentiation of neurologic and cardiac patients from healthy aging patterns supporting its use as a novel biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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