MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4393417691 · doi:10.1101/2024.04.02.587781

Stored Elastic Bending Tension as a Mediator of Embryonic Body Folding

2024· preprint· en· W4393417691 sur OpenAlexaff
Mira Zaher, Ronit Yelin, Alaa A. Arraf, Julian Jadon, Manar Abboud Asleh, Sivan Goltzman, Lihi Shaulov, Dieter P. Reinhardt, Thomas M. Schultheiss

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesIsrael Cancer Research Fund
Mots-clésEctodermConvergent extensionTension (geology)Extracellular matrixAnatomyBiophysicsBendingBending stiffnessContext (archaeology)GastrulationChemistryCell biologyMaterials scienceBiologyEmbryogenesisEmbryoComposite materialUltimate tensile strength

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During development, amniote vertebrate embryos transform from a flat, multi-layered sheet into a three-dimensional cylindrical form, through ventral folding of the lateral sides of the sheet (the lateral plate, LP) and their fusion in the ventral midline. Although this basic aspect of vertebrate body plan formation has long been described, it is not understood at the mechanistic level. Each side of the LP is comprised of two tissue layers: a dorsal somatopleure (Sop) of pseudostratified coelomic epithelium, extracellular matrix (ECM) and ectoderm, and a ventral splanchnopleure (Spl) of similar construction except with endoderm instead of ectoderm. Using a chick embryo slice system we find that the flat stage is actually a poised balance of opposing elastic bending tensions, with dorsal bending tension in the Sop opposing ventral bending tension in the Spl. An intact extracellular matrix is required for generating the bending tensions, as localized enzymatic digestion of Sop or Spl ECM dissipates tension, while removal of the endodermal or ectodermal layers has no effect. As development proceeds, the Sop undergoes Epithelial-Mesenchymal Transition, ECM fragmentation and dissipation of dorsal bending tension, while the Spl ECM and ventral bending tension remain intact, thus changing the balance of bending forces in the LP to promote ventral folding. Consistent with these findings, interference with the elastic ECM component fibrillin in the Spl in vivo reduces stored bending tension and perturbs ventral body folding. A generalizable conceptual model is presented in which embryonic growth, in the context of specific embryonic geometrical constraints, leads to accumulation of bending tension in the LP ECM, which is harnessed to drive body folding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetConnective tissue disorders researchTravaux en français237 207