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Enregistrement W4393950215 · doi:10.1016/j.ccell.2024.03.008

Mutant IDH inhibitors induce lineage differentiation in IDH-mutant oligodendroglioma

2024· article· en· W4393950215 sur OpenAlexaff
Avishay Spitzer, Simon Gritsch, Masashi Nomura, Alexander Jucht, Jérôme Fortin, Ramya Raviram, Hannah Weisman, L. Nicolas Gonzalez Castro, Nicholas Druck, Rony Chanoch-Myers, John J. Y. Lee, Ravindra Mylvaganam, Rachel L. Servis, Jeremy Man Fung, Christine K. Lee, Hiroaki Nagashima, Julie J. Miller, Isabel Arrillaga‐Romany, David N. Louis, Hiroaki Wakimoto, Will Pisano, Patrick Y. Wen, Tak W. Mak, Marc Sanson, Mehdi Touat, Dan A. Landau, Keith L. Ligon, Daniel P. Cahill, Mario L. Suvà, Itay Tirosh

Notice bibliographique

RevueCancer Cell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer CentreMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthServierMassachusetts General HospitalEngineering Research CentersSanofiEuropean CommissionBroad InstituteDana-Farber Cancer InstituteHuman Frontier Science ProgramCouncil for Higher EducationNovocureAgios PharmaceuticalsEli Lilly and Company
Mots-clésOligodendrogliomaMutantBiologyLineage (genetic)TranscriptomeIDH1GliomaCellular differentiationCancer researchCellGeneticsCell biologyGeneGene expressionAstrocytoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A subset of patients with IDH-mutant glioma respond to inhibitors of mutant IDH (IDHi), yet the molecular underpinnings of such responses are not understood. Here, we profiled by single-cell or single-nucleus RNA-sequencing three IDH-mutant oligodendrogliomas from patients who derived clinical benefit from IDHi. Importantly, the tissues were sampled on-drug, four weeks from treatment initiation. We further integrate our findings with analysis of single-cell and bulk transcriptomes from independent cohorts and experimental models. We find that IDHi treatment induces a robust differentiation toward the astrocytic lineage, accompanied by a depletion of stem-like cells and a reduction of cell proliferation. Furthermore, mutations in NOTCH1 are associated with decreased astrocytic differentiation and may limit the response to IDHi. Our study highlights the differentiating potential of IDHi on the cellular hierarchies that drive oligodendrogliomas and suggests a genetic modifier that may improve patient stratification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil0,670

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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