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Enregistrement W4393989857 · doi:10.1158/1538-7445.am2024-lb107

Abstract LB107: Association of circulating free DNA (cfDNA) maximum variant allele frequency (mVAF) levels with clinical outcomes in patients (pts) with metastatic nonsquamous non-small cell lung cancer (NSCLC) treated with pembrolizumab (pembro) + chemotherapy (chemo) in the phase 2 KEYNOTE-782 trial

2024· article· en· W4393989857 sur OpenAlexaff
Jair Bar, Emilio Esteban, Delvys Rodríguez‐Abreu, Santiago Ponce-Aix, Zsuzsanna Szalai, Enriqueta Felip, Maya Gottfried, Mariano Provencio, Andrew Robinson, Andrea Fülöp, S. Rao, D. Ross Camidge, Giovanna Speranza, Nathan Hunkapiller, Robert McDaniel, Byoungsok Jung, David Burkhardt, Ruth E. Mauntz, Cai Chen, Carol E. Peña, Răzvan Cristescu, Elisha J. Dettman, Steven M. Townson, Julie Kobie, Tibor Csőszi

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePembrolizumabLung cancerOncologyInternal medicinenon-small cell lung cancer (NSCLC)Circulating tumor DNACirculating tumor cellCancerImmunotherapyMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: The phase 2 KEYNOTE-782 trial (NCT03664024) was designed to prospectively evaluate plasma-derived biomarkers of response to first-line pembro + chemo in pts with metastatic nonsquamous NSCLC. This exploratory analysis of KEYNOTE-782 evaluated the association of cfDNA mVAF levels with clinical outcomes. Methods: Adults with untreated stage IV nonsquamous NSCLC received pembro 200 mg Q3W + chemo (pemetrexed + carboplatin or cisplatin). cfDNA was isolated from plasma samples collected at baseline (BL) and cycle 2 (C2) and sequenced using a targeted NGS-based assay previously used to assess blood tumor mutational burden from cfDNA for the primary analysis. cfDNA mVAF was quantified for each patient. The associations of BL cfDNA mVAF (all pts) and change in cfDNA mVAF from BL at C2 (pts with ≥1 detectable variant at BL; cfDNA+) as continuous variables with ORR, PFS, and OS were evaluated; 1-sided α was prespecified at 0.05 after multiplicity adjustment. ORR, PFS, and OS were also descriptively evaluated by cfDNA bins (BL mVAF, >0 vs 0; mVAF change from BL, ≥median vs 0 (n = 83) vs 0 (n = 18), ORR (95% CI) was 38.6% (28.1-49.9) vs 55.6% (30.8-78.5), median PFS (95% CI) was 6.6 mo (4.9-9.0) vs 19.7 mo (9.8-not reached [NR]), and median OS (95% CI) was 13.6 mo (9.4-22.5) vs 31.6 mo (20.1-NR). Larger reductions in mVAF from BL at C2 were associated with improved ORR, PFS, and OS (P <0.05, each). The AUROC for discriminating response was 0.69 (95% CI, 0.57-0.82). After adjustment for best overall response, change in mVAF from BL at C2 was not associated with PFS or OS (P >0.05). In a descriptive evaluation for pts with a mVAF change from BL at C2 ≥median of 0.15 (n = 37) vs Citation Format: Jair Bar, Emilio Esteban, Delvys Rodríguez-Abreu, Santiago Ponce-Aix, Zsuzsanna Szalai, Enriqueta Felip, Maya Gottfried, Mariano Provencio Pulla, Andrew Robinson, Andrea Fülöp, Suman Bannur Rao, D. Ross Camidge, Giovanna Speranza, Nathan Hunkapiller, Robert McDaniel, Byoungsok Jung, David Burkhardt, Ruth Mauntz, Cai Chen, Carol Pena, Razvan Cristescu, Elisha J. Dettman, Steven M. Townson, Julie Kobie, Tibor Csőszi. Association of circulating free DNA (cfDNA) maximum variant allele frequency (mVAF) levels with clinical outcomes in patients (pts) with metastatic nonsquamous non-small cell lung cancer (NSCLC) treated with pembrolizumab (pembro) + chemotherapy (chemo) in the phase 2 KEYNOTE-782 trial [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2024; Part 2 (Late-Breaking, Clinical Trial, and Invited Abstracts); 2024 Apr 5-10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(7_Suppl):Abstract nr LB107.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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