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Enregistrement W4394164488 · doi:10.6084/m9.figshare.20401054

Additional file 1 of Dysregulation of Tweak and Fn14 in skeletal muscle of spinal muscular atrophy mice

2022· dataset· en· W4394164488 sur OpenAlexaff
Katharina E. Meijboom, Emma R Sutton, Eve McCallion, Emily McFall, Daniel C. Anthony, Benjamin Edwards, Sabrina Kubinski, Ines Tapken, Ines Bünermann, Gareth Hazell, Nina Ahlskog, Peter Claus, Kay E. Davies, Rashmi Kothary, Matthew J. A. Wood, Mélissa Bowerman

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSpinal muscular atrophySkeletal muscleMedicineAtrophyMuscle atrophyNeurosciencePathologyAnatomyBiologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 1: Supplementary Figure 1. No overt dysregulation of Tweak and Fn14 in skeletal muscle of non-SMA hypomorphic Smn-depleted mice. qPCR analysis of Tweak (a), Fn14 (b), Pgc-1α (c), Mef2d (d), Glut-4 (e), HKII (f) and Klf15 (g) in triceps from post-natal day (P) 7 wild-type (WT), Smn2B/2B and Smn+/- mice. Normalized relative expressions are compared to WT. Data are mean ± SEM, n = 4-5 animals per experimental group, one-way ANOVA, Tukey’s multiple comparison test, * p < 0.05, ns = not significant. Supplementary Figure 2. Tweak and Fn14 are not dysregulated in denervated (nerve cut) muscles of pre-weaned mice. A sciatic nerve cut was performed on post-natal day (P) 7 WT FVB/N mice and both ipsilateral (nerve cut) and contralateral (control) TA muscles were harvested at P14. qPCR analysis of Tweak, Fn14, Pgc-1α, Mef2d, Glut-4, HKII and Klf15 in control and nerve cut TA muscles. Normalized relative expressions for each gene are compared to control muscle. Data are mean ± SEM, n = 7-11 animals per experimental group, two-way ANOVA, uncorrected Fisher’s LSD, ns = not significant. Supplementary Figure 3. Effect of varying Fc-TWEAK doses on disease progression in Smn‍-‍/‍-‍;SMN2 SMA mice. Smn‍-‍/‍-‍;SMN2 mice received daily subcutaneous injections of increasing doses of Fc-TWEAK (7.9, 15., 23.7 and 31.6 μg), starting at birth. a. Daily weights of untreated Smn-/-;SMN2 SMA mice and Smn-/-;SMN2 mice that received daily subcutaneous injections (starting at P0) of Fc-TWEAK (7.9, 15.8, 23.7 and 31.6 μg). Data are mean ± SEM, n = 5-10 animals per experimental group, two-way ANOVA, Sidak’s multiple comparison test. b. Survival curves of untreated Smn-/-;SMN2 SMA mice and Smn-/-;SMN2 mice that received daily subcutaneous injections (starting at P0) of Fc-TWEAK (7.9, 15.8, 23.7 and 31.6 μg). Data are presented as Kaplan-Meier survival curves, n = 5-10 animals per experimental group, Log-rank (Mantel-Cox). Supplementary Figure 4. Differential effect of Fc-TWEAK in skeletal muscle of wild type (WT) and Smn2B/- mice. WT and Smn2B/- SMA mice and received subcutaneous injections of Fc-TWEAK (15.8 μg) every 4 days (from post-natal day (P) 0 to P16) and skeletal muscles were harvested 3 hours post-injections. a-g. qPCR analysis of Fn14 (a), Tweak (b), Pgc-1α (c), Mef2d (d), Glut-4 (e), HKII (f) and Klf15 (g) in triceps of untreated and Fc-TWEAK-treated Smn2B/- mice. Normalized relative expressions for Fc-TWEAK-treated WT mice are compared to untreated WT mice and normalized relative expressions for Fc-TWEAK-treated Smn2B/- mice are compared to untreated Smn2B/- mice. Data are mean ± SEM, n = 3-5 animals per experimental group, two-way ANOVA, uncorrected Fisher’s LSD, * p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001, **** p < 0.0001, ns = not significant. h. Quantification of NF-κB2 p100 protein levels normalized to total protein in the quadriceps of late-symptomatic (P18) Smn2B/- mice and age-matched WT animals. Images are representative immunoblots. Data are mean ± SEM, n = 3-5 animals per experimental group, unpaired t test, p = 0.0005 (WT), p = 0.0494. Supplementary Figure 5. Decreased MuRF-1 expression in skeletal muscle of P7 Fn14-/- mice. qPCR analysis of Atrogin-1 (a) and MuRF-1 (b) in quadriceps and triceps from post-natal day (P) 7 wild type (WT) and Fn14-/- mice. Normalized relative expressions are compared to WT. Data are mean ± SEM, n = 4 animals per experimental group, unpaired t test, p = 0.0164 (MuRF-1 quadriceps), p = 0.0283 (MuRF-1 triceps), ns = not significant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,599

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,9940,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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