Immunity to stripe rust in wheat: A case study of a hypersensitive-response (HR)- independent resistance to Puccinia striiformis f. sp. tritici in Avocet-Yr15
Notice bibliographique
Résumé
Stripe (yellow) rust, caused by the biotrophic fungal pathogen Puccinia striiformis f. sp. tritici (Pst), is emerging as a serious threat to wheat (Triticum aestivum L.) production in many regions of North America. Genetic resistance to stripe rust is typically conditioned by the products of resistance genes that detect pathogen-associated molecular patterns and initiate a cascade of signalling events, culminating in the generation of reactive oxygen species (ROS) and a hypersensitive response (HR) that eventually suppress the pathogen. Complete resistance with no symptoms (immunity response) has also been observed, but less frequently, in certain Pst-wheat interactions. However, such HR-independent resistance responses to Pst have not been well studied. Here we report that the Pst-resistant near isogenic line Avocet-Yr15 (carrying the Yr15 resistance gene) exhibited an immunity response to an isolate of Pst collected in Elora, Ontario, while the Avocet-S line (lacking Yr15) was highly susceptible to the same isolate. In particular, histochemical assays of defence-associated ROS generation and HR were negative during the early stages of the interaction between Pst and the resistant Avocet-Yr15. Microscopic analysis indicated that the pathogen was not able to penetrate the stomata of Avocet-Yr15. Moreover, RNA-sequencing of the immunity response of Avocet-Yr15 to Pst highlighted the activation of a global anti-oxidative-stress response consisting of genes involved in the maintenance of cell viability, redox homoeostasis and photosynthesis. These results provide insights into the molecular mechanisms controlling the immunity response to stripe rust of wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».