MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4394224320 · doi:10.6084/m9.figshare.11874150

New species and reports of <i>Cuphophyllus</i> from northern North America compared with related Eurasian species

2020· dataset· en· W4394224320 sur OpenAlexaboutno aff
Andrus Voitk, Irja Saar, D. Jean Lodge, David Boertmann, Shannon M. Berch, Ellen Larsson

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeographyGenealogyEcologyBiologyHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study describes four gray or brown species of <i>Cuphophyllus</i> (Hygrophoraceae, Agaricales), two of them new species, restricted to arctic-alpine and northern boreal zones of North America, and relates them morphologically and phylogenetically using multigene and nuc rDNA internal transcribed spacer ITS1-5.8S-ITS (ITS barcode) analyses to their similar, known counterparts. <i>Cuphophyllus cinerellus</i>, epitypified here, is shown to be a pan-palearctic species with sequence-confirmed collections from Fennoscandia and easternmost Asia. Occupying a similar habitat in the Nearctic is its sister species, the morphologically similar but novel <i>C. esteriae</i>, so far known only from eastern North America, including Greenland. Sister to the <i>C. cinerellus</i>–<i>C. esteriae</i> lineage, and known only from boreal raised <i>Sphagnum</i> bogs in Newfoundland, is a new medium-sized light cinereous brown species, <i>C. lamarum</i>. It has a yellow stipe but is phylogenetically distant from the yellow-stiped European <i>C. flavipes</i> and its North American sister species, <i>Hygrophorus pseudopallidus</i>. As cryptic speciation was discovered within <i>C. flavipes</i>, we lecto- and epitypify the name and transfer <i>H. pseudopallidus</i> to <i>Cuphophyllus</i> based on ITS analysis of the holotype. We also transfer the small European <i>Hygrocybe comosa</i> to <i>Cuphophyllus</i> based on morphology. <i>Cuphophyllus hygrocyboides</i> is reported from North America with the first sequence-confirmed collections from arctic-alpine British Columbia and Greenland. In addition, sequencing the holotype of <i>C. subviolaceus</i> identifies it as the sister species to the putative <i>C. lacmus</i>. Both species seem to have an intercontinental distribution. In total, we add new sequences to GenBank from 37 <i>Cuphophyllus</i> collections, including the holotypes of <i>C. hygrocyboides</i> and <i>C. subviolaceus</i>, the two new epitypes, and the two novel species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0610,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFigshareMême sujetBryophyte Studies and RecordsTravaux en français237 207