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Enregistrement W4394327924 · doi:10.6084/m9.figshare.21081241

Vegetative cell enlargement in selected centric diatom species – an alternative way to propagate an individual genotype

2022· dataset· en· W4394327924 sur OpenAlexaff
Irena Kaczmarska, James M. Ehrman, Kelsey E. Mills, Steven G. Sutcliffe, B. Samanta

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensMount Allison University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiatomGenotypeResizingBiologyEcologyGeneticsGeneBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vegetative cell enlargement (VCE) and structures involved are documented for the first time using epifluorescence and electron microscopy. We examined three centric diatom species with polar and non-polar valve outlines. VCE progressed in two ways. The first involved liberation of the protoplast, nearly isodiametric expansion, and building of the large frustule in a more or less spherical cell. Protoplast retraction as observed in sexual auxospores before the formation of initial valves was never observed. Cell walls produced a variety of scales, including valve-like scales before the first enlarged epivalve was deposited. VCE wall structures were not similar to auxospore walls of the same species. The morphology of the first enlarged valve, the epivalve, differed from that of typical vegetative valves to a varying degree, depending on the species. The second way to vegetatively enlarge cells involved expansion of the girdle region of the existing small frustule. The circumference of the girdle region grew due to the deposition of irregular, supernumerary copulae. These copulae produced one or more protuberances, resulting in a misshapen cell. This misshapen cell then divided mitotically, and the first enlarged valve was a hypovalve. Hypovalve morphology strongly differed from that of typical vegetative valves. Several subsequent mitotic divisions were required to restore normal, species-specific frustules. Over time, irrespective of the manner of enlargement, the enlarged cells grew well and eventually became more frequent than small cells in our cultures. The scale factors of enlarged cells compared with pre-enlargement size in our experiments (1.1–5.2) were similar to those reported for other species (1.4–7.5). Additionally, we found that size increases from VCE were comparable to those resulting from sexual reproduction of the same species. Therefore, VCE can potentially expand the resident time of the population in the environment to the same degree as would production of sexual initial cells. Species vegetatively restore large cell size in different ways.Scale factors in sexually and vegetatively enlarged cells are similar.VCE may not be as rare as reported in nature. Species vegetatively restore large cell size in different ways. Scale factors in sexually and vegetatively enlarged cells are similar. VCE may not be as rare as reported in nature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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