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Enregistrement W4394378590 · doi:10.6084/m9.figshare.19941580

<i>Talaromyces marneffei</i> activates the AIM2-caspase-1/-4-GSDMD axis to induce pyroptosis in hepatocytes

2022· dataset· en· W4394378590 sur OpenAlexaff
Gang Wang, Wudi Wei, Zhongsheng Jiang, Junjun Jiang, Jing Han, Hong Zhang, Jiaguang Hu, Peng Zhang, Xu Li, Tao Chen, Jinhao He, Zhen Li, Jingzhen Lai, Hao Liang, Chuanyi Ning, Li Ye

Notice bibliographique

RevueTigerPrints (Clemson University) · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPyroptosisAIM2Caspase 1InflammasomeCell biologyChemistryBiologyImmunologyInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Talaromyces marneffei tends to induce systemic infection in immunocompromised individuals, which is one of the causes of the high mortality. The underlying molecular mechanisms of T.marneffei-induced abnormal liver function are still poorly understood. In this study, we found that T.marneffei-infected patients could develop abnormal liver function, evidenced by reduced albumin and increased levels of aspartate aminotransferase (AST) and AST/alanine aminotransferase (ALT). T. marneffei-infected mice exhibited similar characteristics. In vitro investigations showed that T.marneffei induced the death of AML-12 cells. Furthermore, we determined that T.marneffei infection induced pyroptosis in hepatocytes of C57BL/6J mice and AML-12 cells, demonstrated by the increase of AIM2, caspase-1/-4, Gasdermin D(GSDMD) and pyroptosis-related cytokines in T.marneffei-infected mice/cells. Importantly, cell death was markedly suppressed in the presence of VX765 (an inhibitor of caspase-1/-4). Furthermore, in the presence of VX765, T.marneffei-induced pyroptosis was blocked. Nevertheless, necroptosis and apoptosis were also detected in infected animal model at 14 days post-infection. In conclusion, T.marneffei induces pyroptosis in hepatocytes through activation of the AIM2-caspase-1/-4-GSDMD axis, which may be an important cause of liver damage, and other death pathways including necroptosis and apoptosis may also be involved in the later stage of infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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