Establishment and analysis of a novel miRNA prognostic risk model for bladder cancer based on TCGA database
Notice bibliographique
Résumé
膀胱癌是最常见的泌尿道肿瘤，并且由于缺乏可靠的诊断标记物，大多数膀胱癌被诊断为晚期。本研究在TCGA数据库中分析了膀胱癌患者的转录组和临床数据，经过预处理后将其分为试验组和验证组。首先，通过单变量Cox回归分析确定与膀胱癌预后密切相关的miRNA，然后通过多变量Cox回归分析建立基于miRNA表达谱的预后风险模型。通过ROC分析确定患者分类风险水平的最佳分界点，并在验证组和整个组中通过Kaplan-Meier估计来验证预后风险评分类型。 从miRTarBase，targetScan和miRDB的三个miRNA库中至少选择了两个可能的靶基因，并进行了KEGG途径和GO富集分析。所有这些交叉基因都是通过PPI网络和生存分析构建的。最后，建立了5-miRNA（hsa-miR-338-5p，hsa-miR-218-1-3p，hsa-miR-17-3p，hsa-miR-6728-5p，hsa-miR-10a- 3p）已成功构建。多变量Cox分析显示，它具有良好的可预测性，可作为预测膀胱癌患者预后和生存的新生物标志物，并可通过IGF1发挥其生物学功能。
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».