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Enregistrement W4394618940 · doi:10.1080/13816810.2024.2337879

Broadening the ocular phenotypic spectrum of ultra-rare <i>BRPF1</i> variants: report of two cases

2024· article· en· W4394618940 sur OpenAlexfundno aff
Elisa Marziali, Samuela Landini, Erika Fiorentini, Camilla Rocca, Lucia Tiberi, Rosangela Artuso, Laila Zaroili, Elia Dirupo, Pina Fortunato, Sara Bargiacchi, Roberto Caputo, Giacomo Maria Bacci

Notice bibliographique

RevueOphthalmic Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Health, British Columbia
Mots-clésStrabismusGeneticsPhenotypeAniridiaEpigeneticsGenePtosisBiologyMedicineOphthalmologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction BRPF1 gene on 3p26-p25 encodes a protein involved in epigenetic regulation, through interaction with histone H3 lysine acetyltransferases KAT6A and KAT6B of the MYST family. Heterozygous pathogenic variants in BRPF1 gene are associated with Intellectual Developmental Disorder with Dysmorphic Facies and Ptosis (IDDDFP), characterized by global developmental delay, intellectual disability, language delay, and dysmorphic facial features. The reported ocular involvement includes strabismus, amblyopia, and refraction errors. This report describes a novel ocular finding in patients affected by variants in the BRPF1 gene.Methods We performed exome sequencing and deep ocular phenotyping in two unrelated patients (P1, P2) with mild intellectual disability, ptosis, and typical facies.Results Interestingly, P1 had a Chiari Malformation type I and a subclinical optic neuropathy, which could not be explained by variations in other genes. Having detected a peculiar ocular phenotype in P1, we suggested optical coherence tomography (OCT) for P2; such an exam also detected bilateral subclinical optic neuropathy in this case.Discussion To date, only a few patients with BRPF1 variants have been described, and none were reported to have optic neuropathy. Since subclinical optic nerve alterations can go easily undetected, our experience highlights the importance of a more detailed ophthalmologic evaluation in patients with BRPF1 variant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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