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Enregistrement W4394800354

Pulmonary vascular remodeling and PAH : Characterization of PW1+ pulmonary vascular progenitors and regulation by the PDGFRα pathway

2021· preprint· en· W4394800354 sur OpenAlexfundno aff
Julien Solinc

Notice bibliographique

Revuetheses.fr (ABES) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePulmonary Hypertension Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut de Cardiométabolisme et NutritionMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNew South Wales GovernmentFondation pour la Recherche MédicaleNational Health and Medical Research CouncilFondation LeducqLaboratoire d'Excellence en Recherche sur le Médicament et l'Innovation ThérapeutiqueAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésProgenitor cellMedicineLungCell biologyInternal medicineBiologyStem cell
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L’hypertension artérielle pulmonaire (HTAP) est une maladie rare et sévère due à l’occlusion progressive des artérioles pulmonaires. Lors de cette thèse, j’ai étudié les populations de progéniteurs pulmonaires PW1+ et leur régulation par la voie PDGFRα. Chez les patients, le nombre de cellules périvasculaires PW1+/PDGFRα+/αSMA- et celui des cellules PW1+/PDGFRα+/αSMA+ dans la media et la néointima des vaisseaux pulmonaires sont augmentés, potentiellement suite à l’activation de PDGFRα. Dans un modèle murin d’hypertension pulmonaire (HP), l’hypoxie chronique (HC) induit une prolifération et une différenciation des progéniteurs PW1+ en CML, contribuant au remodelage des artérioles pulmonaires. L’inhibition de PDGFRα prévient ces phénomènes précoces sans empêcher l’établissement d’une HP à 28 jours d’HC. A l’inverse, en normoxie, l’activation constitutive de PDGFRα induit la différenciation des progéniteurs PW1+ en CML et la muscularisation des artérioles pulmonaires, ainsi qu’une HP chez les mâles après 5 semaines. In vitro, l’activation de PDGFRα entraine uniquement la prolifération des cellules PW1+/PDGFRα+/c-kit-. Pour conclure, PDGFRα régule la prolifération des progéniteurs PW1+ et leur différenciation en CML, contribuant au remodelage vasculaire lors de l’HTAP. Un 2nd projet a été initié pour caractériser par single-cell RNAseq les différentes populations progénitrices PW1+ et celles qui en dérivent. Nous avons identifié 3 clusters de progéniteurs semblant se différencier en CML d’après l’analyse de trajectoire. L’un des 3 clusters présente une bipotentialité, observée in vitro en différenciant les cellules PW1+/PDGFRα+/c-kit+ en CML et en CE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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