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Enregistrement W4394806441 · doi:10.3390/v16040605

Host Immune Response Modulation in Avian Coronavirus Infection: Tracheal Transcriptome Profiling In Vitro and In Vivo

2024· article· en· W4394806441 sur OpenAlexafffund
Kelsey O’Dowd, Ishara M. Isham, Safieh Vatandour, Martine Boulianne, Charles M. Dozois, Carl A. Gagnon, Neda Barjesteh, Mohamed Faizal Abdul-Careem

Notice bibliographique

RevueViruses · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueFonds de Recherche du Québec - SantéUniversité de MontréalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalEgg Farmers of CanadaInstitut national de la recherche scientifiqueNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'AlimentationCanadian Poultry Research CouncilMcGill University
Mots-clésTranscriptomeIn vivoImmune systemBiologyIn vitroCoronavirusVirologyImmune modulationMicrobiologyImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Gene expressionGeneMedicineGeneticsPathologyInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

causing moderate to severe respiratory infection in chickens. Understanding the initial antiviral response in the respiratory mucosa is crucial for controlling viral spread. We aimed to characterize the impact of IBV Delmarva (DMV)/1639 and IBV Massachusetts (Mass) 41 at the primary site of infection, namely, in chicken tracheal epithelial cells (cTECs) in vitro and the trachea in vivo. We hypothesized that some elements of the induced antiviral responses are distinct in both infection models. We inoculated cTECs and infected young specific pathogen-free (SPF) chickens with IBV DMV/1639 or IBV Mass41, along with mock-inoculated controls, and studied the transcriptome using RNA-sequencing (RNA-seq) at 3 and 18 h post-infection (hpi) for cTECs and at 4 and 11 days post-infection (dpi) in the trachea. We showed that IBV DMV/1639 and IBV Mass41 replicate in cTECs in vitro and the trachea in vivo, inducing host mRNA expression profiles that are strain- and time-dependent. We demonstrated the different gene expression patterns between in vitro and in vivo tracheal IBV infection. Ultimately, characterizing host-pathogen interactions with various IBV strains reveals potential mechanisms for inducing and modulating the immune response during IBV infection in the chicken trachea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,845
Score d'incertitude au seuil0,729

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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