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Enregistrement W4394812519 · doi:10.21203/rs.3.rs-4238470/v1

Incidences of colorectal adenomas and cancers under colonoscopy surveillance suggest an accelerated “Big Bang” pathway to CRC in three of the four Lynch syndromes

2024· preprint· en· W4394812519 sur OpenAlexaff
Pål Møller, Saski Haupt, Aysel Ahadova, Matthias Kloor, Julian R. Sampson, Lone Sunde, Toni T. Seppälä, John Burn, Inge Bernstein, Gabriel Capellá, D. Gareth Evans, Annika Lindblom, Ingrid Winship, Finlay Macrae, Lior H. Katz, Ido Laish, E Vainer, Kevin Monahan, Elizabeth Half, Karoline Horisberger, Leandro Apolinário da Silva, Vincent Heuveline, Christina Therkildsen, Charlotte Kvist Lautrup, Louvise L Klarskov, Giulia Martina Cavestro, Gabriela Möslein, Eivind Hovig, Mev Dominguez–Valentin

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensRoyal Ottawa Mental Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMSH6ColonoscopyPMS2MedicineLynch syndromeMLH1Colorectal cancerMSH2Internal medicineAdenomaIncidence (geometry)MalignancyGastroenterologyOncologyCancerDNA mismatch repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Colorectal cancers (CRCs) in the Lynch syndromes have been assumed to emerge through an accelerated adenoma-carcinoma pathway. In this model adenomas with deficient mismatch repair have an increased probability of acquiring additional cancer driver mutation(s) resulting in more rapid progression to malignancy. If this model was accurate, the success of colonoscopy in preventing CRC would be a function of the intervals between colonoscopies and mean sojourn time of detectable adenomas. Contrary to expectations, colonoscopy did not decrease incidence of CRC in the Lynch syndromes and shorter colonoscopy intervals have not been effective in reducing CRC incidence. The prospective Lynch Syndrome Database [PLSD) was designed to examine these issues in carriers of pathogenic variants of the mis-match repair [path_MMR) genes. Material and methods: We examined the CRC and colorectal adenoma incidences in 3,574 path_MLH1, path_MSH2, path_MSH6 and path_PMS2 carriers subjected to regular colonoscopy with polypectomy, and considered the results based on sojourn times and stochastic probability paradigms. Results: Most of the path_MMR carriers in each genetic group had no adenomas. There was no association between incidences of CRC and the presence of adenomas. There was no CRC observed in path_PMS2 carriers. Conclusions: Colonoscopy prevented CRC in path_PMS2 carriers but not in the others. The findings are consistent with colonoscopy surveillance blocking the adenoma-carcinoma pathway by removing adenomas which might otherwise become CRCs. However, in carriers other than path_PMS2, most CRCs observed in carriers subjected to colonoscopy likely arise from dMMR cells in the crypts that have an increased mutation rate with increased stochastic chaotic probabilities for mutations. This mechanism, that may be associated with no or only a short sojourn time of MSI tumours as adenomas, could explain the findings in our previous and current reports.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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