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Enregistrement W4394873115 · doi:10.1177/10668969241234321

The 1000 Mitoses Project: A Consensus-Based International Collaborative Study on Mitotic Figures Classification

2024· article· en· W4394873115 sur OpenAlexaff
Sherman Lin, Christopher Tran, Ela Bandari, Tommaso Romagnoli, Yueyang Li, Michael Chu, Abinaya Sundari Amirthakatesan, Adam Dallmann, A. O. Kostiukov, Ángel Panizo, Anjelica Hodgson, Anna Laury, António Polónia, Ashley Stueck, Aswathy Ashok Menon, Aurélien Morini, Birsen Gizem Özamrak, Caroline Cooper, Celestine Trinidad, Christian Eisenlöffel, Dauda E. Suleiman, David Suster, David A. Dorward, Eman Aljufairi, Fiona Maclean, Gulen Gul, Irene Sansano, Irma Elisa Eraña Rojas, Isidro Machado, Ivana Kholová, Jayanthi Karunanithi, Jean‐Baptiste Gibier, Jefree J. Schulte, Joshua Li, Jyoti Kini, Katrina Collins, Laurence A. Galea, Louis Muller, Luca Cima, Luiz M. Nova‐Camacho, Marcus Dabner, Matthew J. Muscara, Matthew G. Hanna, Mehdi Agoumi, Nicholas J. P. Wiebe, N. Oswald, Nusrat Zahra, Olaleke Oluwasegun Folaranmi, Oleksandr Kravtsov, Orhan Semerci, Namrata N. Patil, Preethi Muthusamy Sundar, P. Charles, Priyadarshini Kumaraswamy Rajeswaran, Qi Zhang, Rachael van der Griend, Raghavendra Pillappa, Raul Perret, Raul S. González, Robyn C. Reed, Sachin Patil, Xiaoyin “Sara” Jiang, Sumaira Qayoom, Susan Prendeville, Swikrity Upadhyay Baskota, Thanh-Truc Tran, Thar-Htet San, Tiia-Maria Kukkonen, Timothy J. Kendall, Toros Taşkın, Tristan Rutland, Varsha Manucha, Vincent Cockenpot, Yale Rosen, Yessica P. Rodriguez-Velandia, Zehra Ordulu, Matthew J. Cecchini

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Surgical Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of CalgarySurrey Memorial HospitalDalhousie UniversityUniversity Health NetworkLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteHacettepe ÜniversitesiMedizinischen Hochschule HannoverFeinberg School of MedicineRowan UniversityNorthwestern University
Mots-clésMitosisGrading (engineering)Mitotic indexComputer scienceMedicineMedical physicsBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction. The identification of mitotic figures is essential for the diagnosis, grading, and classification of various different tumors. Despite its importance, there is a paucity of literature reporting the consistency in interpreting mitotic figures among pathologists. This study leverages publicly accessible datasets and social media to recruit an international group of pathologists to score an image database of more than 1000 mitotic figures collectively. Materials and Methods. Pathologists were instructed to randomly select a digital slide from The Cancer Genome Atlas (TCGA) datasets and annotate 10-20 mitotic figures within a 2 mm 2 area. The first 1010 submitted mitotic figures were used to create an image dataset, with each figure transformed into an individual tile at 40x magnification. The dataset was redistributed to all pathologists to review and determine whether each tile constituted a mitotic figure. Results. Overall pathologists had a median agreement rate of 80.2% (range 42.0%-95.7%). Individual mitotic figure tiles had a median agreement rate of 87.1% and a fair inter-rater agreement across all tiles (kappa = 0.284). Mitotic figures in prometaphase had lower percentage agreement rates compared to other phases of mitosis. Conclusion. This dataset stands as the largest international consensus study for mitotic figures to date and can be utilized as a training set for future studies. The agreement range reflects a spectrum of criteria that pathologists use to decide what constitutes a mitotic figure, which may have potential implications in tumor diagnostics and clinical management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,615
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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