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Enregistrement W4394895507 · doi:10.34172/jkmu.2024.01

Correlation of 2,4-DDT with CDH1 Gene Promoter Methylation in Gastric Cancer

2024· article· en· W4394895507 sur OpenAlexaff
Mohammad Reza Ashrafi, Gholamreza Asadikaram, Sodaif Darvish-Moghaddam, Moslem Abolhassani, Maryam Iranpour, Zahra Sepehri

Notice bibliographique

RevueMajallah-i dānishgāh-i ̒ulum-i pizishkī-i Kirmān. · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCDH1PromoterMethylationDNA methylationCancerEpigeneticsMolecular biologyGeneCancer researchBiologyGene expressionCellCadherinGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Methylation alterations of tumor suppressor gene promoters are important epigenetic changes in gastric cancer. CDH1 encodes a protein (cadherin1) with essential roles in cell-cell adhesion. In this study, the association of organochlorine pesticide (OCP) serum levels with the methylation profile of this gene was investigated in gastric cancer, intestinal metaplasia (IM), and functional dyspepsia (FD) patients. Methods: Gastric cancer (n=34), IM (n=8), and FD (n=48) patient serums were analyzed for the determination of OCP levels by gas chromatography. The methylation status of the CDH1 gene promoter was examined by the methylation-specific PCR (MSP) method. Immunohistochemistry (IHC) was used to confirm the reduced protein expression of this gene in methylated samples. Results: Our findings revealed significant hypermethylation of the CDH1 gene promoter and its reduced expression in gastric cancer patients compared with IM and FD patients. Furthermore, there was a significant association between CDH1 promoter hypermethylation and 2,4-DDT (OR=1.183; 95% CI=1.001–1.398; P=0.048) serum levels in gastric cancer patients. Conclusion: Our results suggest an association between 2,4-DDT OCP levels in gastric cancer patient serums with CDH1 gene promoter hypermethylation. Additionally, this gene promoter’s methylation may play a role in the progression of pre-cancerous IM towards gastric cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,226
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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