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Enregistrement W4394961497 · doi:10.3389/fimag.2024.1373420

ChestBioX-Gen: contextual biomedical report generation from chest X-ray images using BioGPT and co-attention mechanism

2024· article· en· W4394961497 sur OpenAlexafffund
Mohammed Yasser Ouis, Moulay A. Akhloufi

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Imaging · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesAlliance de recherche numérique du CanadaNew Brunswick Innovation FoundationFondation de la recherche en santé du Nouveau-Brunswick
Mots-clésMechanism (biology)MedicinePsychologyPhilosophyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Efficient and accurate radiology reporting is critical in modern healthcare for timely diagnosis and patient care. In this paper, we present a novel deep learning approach that leverages BioGPT and co-attention mechanisms for automatic chest X-ray report generation. Our model, termed “ChestBioX-Gen” is designed to bridge the gap between medical images and textual reports. BioGPT, a biological language model, contributes its contextual understanding to the task, while the co-attention mechanism efficiently aligns relevant regions of the image with textual descriptions. This collaborative combination enables ChestBioX-Gen to generate coherent and contextually accurate reports that embed complex medical findings. Our model not only reduces the burden on radiologists but also enhances the consistency and quality of reports. By automating the report generation process, ChestBioX-Gen contributes to faster diagnoses and improved patient care. Quantitative evaluations, measured through BLEU-N and Rouge-L metrics, demonstrate the model's proficiency in producing clinically relevant reports with scores of 0.6685, 0.6247, 0.5689, 0.4806, and 0.7742 on BLUE 1, 2, 3, 4, and Rouge-L, respectively. In conclusion, the integration of BioGPT and co-attention mechanisms in ChestBioX-Gen represents an advancement in AI-driven medical image analysis. As radiology reporting plays a critical role in healthcare, our model holds the potential to revolutionize how medical insights are extracted and communicated, ultimately benefiting both radiologists and patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,946
Score d'incertitude au seuil0,892

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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