Clinical, phenotypic, and genotypic characteristics of ESBL-producing Salmonella enterica bloodstream infections from Qatar
Notice bibliographique
Résumé
Resistant Salmonella infections is a major global public health challenge particularly for multidrug resistant (MDR) isolates manifesting as bloodstream infections (BSIs). To evaluate clinical, phenotypic and genotypic characteristics of ESBL producing Salmonella enterica bloodstream infections from Qatar. Phenotypic ESBL Salmonella enterica collected from adults’ patients presenting with positive BSIs were collected between January 2019-May 2020. Microbiological identification and characterization were performed using standard methods while genetic characteristics were examined through whole genome sequencing studies. Out of 151 episodes of Salmonella enterica BSI, 15 (10%) phenotypic ESBL isolates were collected. Recent travel was recorded in most cases (80%) with recent exposure to antimicrobials (27%). High level resistance to quinolines, aminoglycosides and cephalosporins was recorded (80-100 %) while meropenem, tigecycline and colistin demonstrated universal susceptibility. Genomic evaluation demonstrated dominance of serotype ST1 (93 %) while antimicrobial resistance genes revealed dominance of aminoglycoside resistance (100 %), qnrS1 quinolones resistance (80%), blaCTX-M-15 ESBLs (86.7 %), and paucity of AmpC resistance genes (6.7%). Invasive MDR Salmonella enterica is mainly imported, connected to patients from high prevalent regions with recent travel and antimicrobials use caused by specific resistant clones. In suspected cases of multidrug resistance, carbapenems therapy is recommended.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».