Apirhabdus apintestini gen. nov., sp. nov., a member of a novel genus of the family Enterobacteriaceae, isolated from the gut of the western honey bee Apis mellifera
Notice bibliographique
Résumé
A Gram-negative, motile, rod-shaped bacterial strain, CA-0114 T , was isolated from the midgut of a western honey bee, Apis mellifera . The isolate exhibited ≤96.43 % 16S rRNA gene sequence identity (1540 bp) to members of the families Enterobacteriaceae and Erwiniaceae . Phylogenetic trees based on genome blast distance phylogeny and concatenated protein sequences encoded by conserved genes atpD , fusA, gyrB , infB , leuS , pyrG and rpoB separated the isolate from other genera forming a distinct lineage in the Enterobacteriaceae . In both trees, the closest relatives were Tenebrionicola larvae YMB-R21 T and Tenebrionibacter intestinalis BIT-L3 T , which were isolated previously from Tenebrio molitor L., a plastic-eating mealworm. Digital DNA–DNA hybridization, orthologous average nucleotide identity and average amino acid identity values between strain CA-0114 T and the closest related members within the Enterobacteriaceae were ≤23.1, 75.45 and 76.04 %, respectively. The complete genome of strain CA-0114 T was 4 451669 bp with a G+C content of 52.12 mol%. Notably, the apparent inability of strain CA-0114 T to ferment d -glucose, inositol and l -rhamnose in the API 20E system is unique among closely related members of the Enterobacteriaceae . Based on the results obtained through genotypic and phenotypic analysis, we propose that strain CA-0114 T represents a novel species and genus within the family Enterobacteriaceae , for which we propose the name Apirhabdus apintestini gen. nov., sp. nov. (type strain CA-0114 T =ATCC TSD-396 T =DSM 116385 T ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».