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Enregistrement W4395036449 · doi:10.1161/circ.144.suppl_1.14257

Abstract 14257: Ribosome-Profiling Reveals Translational Control of SND1 as a Determinant of Endothelial Homeostasis in a hiPSC Model of Sunitinib-Induced Vascular Dysfunction

2021· article· en· W4395036449 sur OpenAlexaff
Zhenbo Han, Jordan Jousma, Mehdi Amiri, Negar Tabatabaei, Sarath Babu Nukala, Youjeong Kwon, Gege Yan, Soroush Tahmasebi, Won Hee Lee, Sang‐Ging Ong

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSunitinibHomeostasisRibosome profilingProfiling (computer programming)Internal medicineCardiologyRibosomeGeneticsRNABiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The advent of tyrosine kinase inhibitors in cancer therapies has contributed towards the lowered mortality rate from cancer deaths; however, resulting vascular toxicity from such drugs increases the risk for fatal heart disease in cancer survivors. Thus, a better understanding of the mechanisms related to adverse cardiovascular effects is needed to improve mortality rates in cancer survivors. Hypothesis: The objective of this study is to identify previously unrecognized molecular targets that are regulated at a translational level which may contribute to sunitinib-induced vascular toxicity. Methods and Results: A human induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells (hiPSC-EC) model of sunitinib-induced vascular dysfunction was established. Ribosome profiling which allows the selective sequencing of translated RNA regions identified Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 (SND1) as a translationally-repressed gene caused by sunitinib exposure. Mechanistically, we identified that sunitinib repressed SND1 by inhibiting mTOR which in turn dephosphorylates 4E-BP. Double-knockdown of 4E-BP1/2 reversed sunitinib-induced repression of SND1. Loss-of-function studies revealed that SND1 inhibition led to endothelial dysfunction as measured by reduced cell viability, impaired angiogenic capability, and reduced wound healing; effects which were blunted in reciprocal SND1 gain-of-function studies in the presence of sunitinib treatment. Furthermore, our results revealed that SND1 transcriptionally regulates UBC13, an E2-conjugating enzyme that mediates K63-linked ubiquitination. Pharmacological inhibition of UBC13 also led to endothelial dysfunction similar to the detrimental effects of sunitinib or SND1 inhibition. Conclusions: Our study demonstrates that translational control of SND1 which acts through UBC13 is a previously unidentified mechanism that can potentially be manipulated for therapeutic benefits to reduce sunitinib-induced vascular toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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