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Enregistrement W4395067780 · doi:10.1139/cjb-2023-0147

Phylogenetic placement of <i>Carex dianae</i> Steud., a sedge endemic to the South Atlantic island of St. Helena

2024· article· en· W4395067780 sur OpenAlexafffundvenue
Cassandra D.V. Bradshaw, Diana M. Percy, Vanessa Thomas-Williams, Rebecca Cairns-Wicks, Alan Gray, Quentin Cronk

Notice bibliographique

RevueBotany · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotany, Ecology, and Taxonomy Studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBotanyPhylogenetic treeCarexCyperaceaePhylogenetic relationshipPhylogeneticsEcologyPoaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carex dianae Steud. is an endemic sedge of St. Helena, an isolated island in the South Atlantic. Our study provides the first molecular sequence data for this taxon. We generated sequence data for plastid matK and trnK regions and nuclear internal transcribed spacer and external transcribed spacer regions to determine the placement of C. dianae in the broader Carex phylogeny. The placement of C. dianae falls within Carex sect. Spirostachyae Drejer, and it is sister to a clade including Carex clavata Thunb., Carex aethiopica Schkuhr (both from the Cape region of S. Africa), and Carex gunniana Boott (southern Australia). The existence of three divergent nucleotype groups and two plastotypes is revealed from genetic variation within C. dianae. The results suggest that the ancestor of C. dianae likely originated in the Cape region of South Africa, followed by transoceanic dispersal to St. Helena estimated at 4.4–4.9 million years ago, likely by a bird vector. The most divergent population is that on an isolated hill known as “The Barn”, which may represent a distinct taxon. The existence of highly structured molecular variation within an island only 16 km long is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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