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Enregistrement W4395465087 · doi:10.1007/s11105-024-01459-0

Development of a Csy4-Processing TRV-Based CRISPR/Cas9 Genome Editing System in Nicotiana benthamiana

2024· article· en· W4395465087 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePlant Molecular Biology Reporter · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésNicotiana benthamianaCRISPRBiologyGenome editingCas9Computational biologyGenomeGuide RNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The CRISPR/Cas9 system is a site-specific genome editing tool that has been widely used in various plant species. The plant virus-based gRNA (guide RNA) delivery system, which differs from the typical Agrobacterium -mediated transformation, is an attractive method to facilitate the application of CRISPR/Cas9. The virally delivered gRNA is usually driven by heterologous plant U6 or viral promoters (e.g., pea early-browning virus, PEBV; barley stripe mosaic virus, BSMV). However, heterologous promoters may have poor performance in some cases. In this paper, a feasible option to detach gRNA(s) from the virus genome is employed. Specifically, the Csy4-RNA processing system is used to release gRNA(s) from the tobacco rattle virus (TRV). The coding sequences of Cas9 and Csy4 nucleases are cloned into a single polycistronic expression cassette under an estrogen-inducible promoter in a binary vector, and the gRNA is cloned into the TRV genome flanked by two 20 bp Csy4 recognition sites. The results show that the Csy4-processing TRV-based delivery system works effectively in targeting single and multiple sites, nucleotide replacement, and large fragment deletion in Cas9-mediated genome editing via transient expression in Nicotiana benthamiana . The Csy4-TRV is a promising gRNA(s) processing and delivery system for CRISPR/Cas9 genome editing. This method can be easily adapted to other plant RNA viruses, facilitating the application of the CRISPR/Cas9 system in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,204
Score d'incertitude au seuil0,903

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle