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Enregistrement W4395667431 · doi:10.7554/elife.96868.1.sa2

eLife Assessment: Thymic dendritic cell-derived IL-27p28 promotes the establishment of functional bias against IFN-γ production in newly generated CD4+ T cells through STAT1-related epigenetic mechanisms

2024· peer-review· en· W4395667431 sur OpenAlexaff
Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaJinan University
Mots-clésEpigeneticsBiologySTAT1Dendritic cellImmunologyInterferonCell biologyComputational biologyGeneticsGeneImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The newly generated CD4 single-positive (SP) T lymphocytes are featured by enhanced IL-4 but repressed IFN-γ production. The mechanisms underlying this functional bias remain elusive. Previous studies have reported that CD4+ T cells from mice harboring DC-specific deletion of IL-27p28 display an increased capacity of IFN-γ production upon TCR stimulation. Here we demonstrated that similarly altered functionality occurred in CD4SP thymocytes, recent thymic emigrants (RTEs) as well as naive T cells from either Cd11c-p28f/f mice or mice deficient in the α subunit of IL-27 receptor. Therefore, DC-derived IL-27p28-triggered, IL-27Rα-mediated signal is critically involved in the establishment of functional bias against IFN-γ production during their development in the thymus. Epigenetic analyses indicated reduced DNA methylation of the Ifng locus and increased trimethylation of H3K4 at both Ifng and Tbx21 loci in CD4SP thymcoytes from Cd11c-p28f/f mice. Transcriptome profiling demonstrated that Il27p28 ablation resulted in coordinated up-regulation of STAT1-activated genes. Concurrently, STAT1 was found to be constitutively activated. Moreover, we observed increased accumulation of STAT1 at the Ifng and Tbx21 loci and a strong correlation between STAT1 binding and H3K4me3 modification of these loci. Of note, Il27p28 deficiency exacerbated the autoimmune phenotype of Aire-/- mice. Collectively, this study reveals a novel mechanism underlying the functional bias of newly generated CD4+ T cells and the potential relevance of such a bias in autoimmunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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