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Enregistrement W4395954869 · doi:10.1101/2024.04.23.590821

Panx1 Ablation Aggravates Oxidative Stress and Cell Death by Altering AMPK/mTOR signaling Pathways and the Composition of Synapses in the Zebrafish

2024· preprint· en· W4395954869 sur OpenAlexafffund
Nickie Safarian, Christiane Zoidl, Steven A. Connor, Georg Zoidl

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHospital for Sick ChildrenYork University
Mots-clésZebrafishMPTPBiologyNeuroscienceControl reconfigurationCell biologyComputer scienceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pannexin-1 channels have garnered attention for their implications in neurodevelopment, potentially having a dual role in mediating a delicate balance between cell death and survival. However, a comprehensive understanding of the underlying molecular and cellular mechanisms and Panx1’s potential protective functions throughout neurodevelopment remains to be determined. Zebrafish larvae with loss of Pannexin-1a function were subjected to an acute exposure to 1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (MPTP). Early-life changes in larvae induced by uncoupling of oxidative phosphorylation were investigated by a computational Gene Set Expression Analysis of RNA-seq data and experimental testing of light-stimulated locomotor behavior, cell death, and bioelectrical properties of local field potentials in the ascending visual pathway. A KEGG pathway analysis underscored Panx1a’s regulatory influence on neurodevelopment. Targeting Panx1a caused a deregulation of oxidative phosphorylation, glycolysis, reactive oxygen production, hypoxia, unfolded protein response pathways, and reduced extracellular ATP. Further, Panx1a ablation enhanced the transcriptional activation of 5’ AMP-activated protein kinase (AMPK) kinase, a cellular energy sensor activated by falling energy status, largely to activate glucose and fatty acid uptake and oxidation when cellular energy is low. The activation of the AMPK pathway in Panx1a knock-out larvae correlated with the stimulation of the mammalian target of rapamycin (mTORC1) pathway that controls cellular metabolism, catabolism, immune responses, autophagy, survival, proliferation, and migration, to maintain cellular homeostasis. The differential expression of mTORC1 pathway genes associated with autophagy, and apoptosis signaling pathways. The resultant cell death was pronounced in the pallium and tectum regions. The loss of cells interrelated with a trans-synaptic a loss of synaptic neurotransmitter receptor and ion channel/transporter expression. Local field potential recordings in the optic tectum and pallium demonstrated that Panx1a’s involvement in modulating local neuronal networks was altered. Collectively, the results shed light on the impacts of acute MPTP treatment on locomotor behavior, transcriptomic shifts, metabolic disturbances, and the pivotal role of Panx1a in cell death. These insights enhance our comprehension of the intricate molecular and cellular mechanisms underpinning neurodevelopment, with implications for potential therapeutic strategies targeting Panx1 channels in autism and Alzheimer’s disease. Graphical Abstract Highlights A genetic model was combined with the neurotoxin MPTP to explore the roles of zebrafish Pannexin-1 channels in neurodevelopment under oxidative stress conditions. A potential beneficial impact of targeting Panx1a is superseded by synaptic plasticity loss, dysfunctional mitochondrial metabolism, and cell death pathway activation. Loss of Panx1a amplifies AMPK/mTORC1 pathway activation of cell death pathways. A role of Panx1a as a regulator of energy and synaptic homeostasis was identified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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