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Enregistrement W4396172095 · doi:10.15468/dl.fmdq5b

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2023· dataset· en· W4396172095 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueGlobal Biodiversity Information Facility · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownloadComputer scienceGeographyWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A dataset containing 112362 species occurrences available in GBIF matching the query: { "and" : [ "TaxonKey is one of (Melampsoridium hiratsukanum S.Ito ex Hirats.f., Podosphaera macularis (Wallr.) U.Braun & S.Takam., Discula destructiva Redlin, Phakopsora meibomiae (Arthur) Arthur, Tilletia indica Mitra, Phialophora cinerescens (Wollenw.) J.F.H.Beyma, Mycosphaerella rabiei Kovatsch. ex Gruyter, Stigmina deflectens (P.Karst.) M.B.Ellis, Ophiostoma tenellum (R.W.Davidson) M.Villarreal, Crustodontia chrysocreas (Berk. & M.A.Curtis) Hjortstam & Ryvarden, Melampsora larici-populina Kleb., Sphaeropsis sapinea (Fr.) Dyko & B.Sutton, Ceratocystis fimbriata Ellis & Halst., Gymnosporangium sabinae (Dicks.) G.Winter, Elsinoe australis Bitanc. & Jenkins, Ustilago esculenta Henn., Mycosphaerella laricina (R.Hartig) Mig., Puccinia hemerocallidis Thüm., Cyclaneusma minus (Butin) DiCosmo, Peredo & Minter, Venturia saliciperda Nüesch, Rhytisma acerinum (Pers.) Fr., Ceratocystis fagacearum (Bretz) J.Hunt, Fusarium circinatum Nirenberg & O'Donnell, Puccinia P.Micheli ex Haller, 1768, Gnomoniopsis smithogilvyi L.A.Shuttlew., E.C.Y.Liew & D.I.Guest, Ophiostoma piliferum (Fr.) Syd. & P.Syd., Cronartium pini (Willd.) Jørst., Amanita phalloides (Vaill. ex Fr.) Link, Dichotomophthora Mehrlich & Fitzpatrick, 1935, Pestalotiopsis disseminata (Thüm.) Steyaert, Neonectria coccinea (Pers.) Rossman & Samuels, Huntiella moniliformis (Hedgc.) Z.W.de Beer, T.A.Duong & M.J.Wingf., Verticillium alboatrum Reinke & Berthold, Tilletia walkeri Castl. & Carris, Stromatinia cepivora (Berk.) Whetzel, Fusarium graminearum Schwabe, Bipolaris maydis (Y.Nisik. & C.Miyake) Shoemaker, Graphium euwallaceae Twizeyim., S.C.Lynch & Eskalen, Phyllosticta citricarpa (McAlpine) Aa, Ophiognomonia clavigignenti-juglandacearum (V.M.G.Nair, Kostichka & J.E.Kuntz) Broders & G.J.Boland, Dothistroma septosporum (Dorogin) M.Morelet, Ophiostoma novo-ulmi Brasier, Lachnellula willkommii (R.Hartig) Dennis, Graphium kuroshium F.Na, J.D.Carrillo & Eskalen, Raffaelea lauricola T.C.Harr., Fraedrich & Aghayeva, Puccinia modiolae P.Syd. & Syd., Leptographium procerum (W.B.Kendr.) M.J.Wingf., Phakopsora pachyrhizi Syd. & P.Syd., Septoria glycines Hemmi, Eballistra oryzae (Syd. & P.Syd.) R.Bauer, Begerow, A.Nagler & Oberw., Puccinia graminis Pers., Helicobasidium longisporum Wakef., Fusarium oxysporum Schltdl., Tilletia caries (DC.) Tul. & C.Tul., Nalanthamala diospyri (Crand.) Schroers & M.J.Wingf., Lecanosticta acicola (Thüm.) Syd., Phyllachora maydis Maubl., Epicoccum sorghinum (Sacc.) Aveskamp, Gruyter & Verkley, Apiognomonia veneta (Sacc. & Speg.) Höhn., Neonectria faginata (M.L.Lohman, A.M.J.Watson & Ayers) Castl. & Rossman, Cryphonectria parasitica (Murrill) M.E.Barr, Paracremonium pembeum S.C.Lynch & Eskalen, Puccinia striiformis Westend., Puccinia chondrillina Bubák & Syd., Cryptodiaporthe populea (Sacc.) Butin, Calonectria pseudonaviculata (Crous, J.Z.Groenew. & C.F.Hill) L.Lombard, M.J.Wingf. & Crous, Leptographium wingfieldii M.Morelet, Gremmeniella abietina (Lagerb.) M.Morelet, Urocystis tritici Körn., Claviceps africana Freder., Mantle & De Milliano, Allantophomopsiella pseudotsugae (M.Wilson) Crous, Pseudogymnoascus destructans (Blehert & Gargas) Minnis & D.L.Lindner, Amylostereum areolatum (Chaillet ex Fr.) Boidin, Puccinia pelargonii-zonalis Doidge, Gymnosporangium asiaticum Miyabe ex G.Yamada, Golovinomyces verbasci (Jacz.) V.P.Heluta, Colletotrichum queenslandicum B.S.Weir & P.R.Johnst., Puccinia suaveolens (Pers.) Rostr., Sporisorium cruentum (J.G.Kühn) Vánky, Puccinia calcitrapae DC., Batrachochytrium dendrobatidis Longcore, Pessier & D.K.Nichols, Uromyces transversalis (Thüm.) G.Winter, Austropuccinia psidii (G.Winter) Beenken, Neocosmospora euwallaceae (S.Freeman, Z.Mendel, T.Aoki & O'Donnell) Sand.-Den., L.Lombard & Crous, Chrysomyxa rhododendri (DC.) de Bary, Ophiostoma ulmi (Buisman) Nannf., Rigidoporus vinctus (Berk.) Ryvarden, Cronartium ribicola A.Dietr., Fusarium kuroshium (F.Na, J.D.Carrillo & A.Eskalen ex Sand.-Den. & Crous) O'Donnell, Geiser, Kasson & T.Aoki, Erythricium salmonicolor (Berk. & Broome) Burds., Oxyporus subulatus Ryvarden, Psammonobiotus communis Golemansky, 1967, Skeletonema potamos (C.I.Weber) Hasle, 1976, Trochammina hadai Uchio, 1962, Colpomenia peregrina Sauv., Coscinodiscus wailesii Gran & Angst, 1931, Stephanodiscus binderanus (Kützing) Krieger, 1927, Peronospora belbahrii Thines, Thalassiosira punctigera Castracane, 1886, Phytophthora ramorum Werres, De Cock & Man, Sargassum horneri (Turner) C.Agardh, 1820, Stephanodiscus subtilis (Goor) A.Cleve, 1951, Elachista Duby, 1830, Phytophthora pseudocryptogea Safaief., Mostowf., G.E.Hardy & T.I.Burgess, Undaria pinnatifida (Harv.) Suringar, Phytophthora lateralis Tucker & Milbrath, Cyclotella atomus Hustedt, 1937, Chorda Stackhouse, 1797, Dictyota ciliolata O.G.Sond. ex Kütz., Cutleria cylindrica Okam., Hymenomonas roseola F.Stein, Psammonobiotus Golemansky, 1968, Odontella sinensis (Greville) Grunow, 1884, Phytophthora cinnamomi Rands, Skeletonema subsalsum (Cleve-Euler) Bethge, 1928, Prymnesium parvum N.Carter, Sphacelaria H.C.Lyngbye, 1818, Phytophthora tentaculata Kröber & Marwitz, Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerh., Cyclotella pseudostelligera Hustedt, 1939, Acineta nitocrae, Ancistrum cyclidioides (Issel, 1918), Thalassiosira baltica (Grunow) Ostenfeld, 1901, Phytophthora quercina T.Jung, Sargassum muticum Yendo, Cotton leafroll dwarf virus, Influenza A virus, Plantago asiatica mosaic virus, Monkeypox virus, Tomato yellow leaf curl virus, Tulip virus X, Carp sprivivirus, Sweet potato chlorotic stunt virus, West Nile virus, Hop stunt viroid, Rabbit hemorrhagic disease virus, Soybean dwarf virus, Colombian datura virus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Potato mop-top virus, Cowpea mild mottle virus, Cucumber green mottle mosaic virus, Fowlpox virus, Bean common mosaic necrosis virus, Avocado sunblotch viroid, Cotton leaf curl Gezira virus, Bean common mosaic virus, Xanthomonas citri, Aeromonas salmonicida (Lehmann & Neumann, 1896) Griffin et al., 1953, Renibacterium salmoninarum Sanders & Fryer, 1980, Xanthomonas oryzae, Xanthomonas campestris (Pammel, 1895) Dowson, 1939, Cylindrospermopsis raciborskii (Wołosz.) Seenayya & Subbaraju, Liberibacter asiaticus)", "BasisOfRecord is one of (Specimen, Human Observation, Observation, Machine Observation)", { "not" : { "Country" : [ "is one of (United States of America, Canada, Mexico)" ] } }, "HasCoordinate is true", "OccurrenceStatus is Present", "Year is greater than or equal to 1990", "CoordinateUncertaintyInMeters is less than 1000", "ScientificName is not null", "DecimalLongitude is not null", "DecimalLatitude is not null" ] } The dataset includes 112362 records from 267 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032193-231120084113126/datasets/export for details. Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,754
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0070,012
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2460,354

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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