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Enregistrement W4396229659 · doi:10.1097/fpc.0000000000000533

Novel variant in Nudix hydrolase 15 gene influences 6-mercaptopurine toxicity in childhood acute lymphoblastic leukemia patients

2024· article· en· W4396229659 sur OpenAlexaff
Zarina Sabirova, Shazia Mahnoor, Dina Lasfar, Vincent Gagné, Yves Théorêt, Jean Marie Leclerc, Caroline Laverdière, Daniel Sinnett, Thai-Hoa Tran, Maja Krajinović

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThiopurine methyltransferaseMercaptopurineMedicinePharmacogeneticsAdverse effectAlleleGenotypePharmacologyInternal medicineGeneOncologyBiologyGeneticsDiseaseAzathioprine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most frequent pediatric cancer. 6-Mercaptopurine (6-MP) is a key component of ALL treatment. Its use, however, is also associated with adverse drug reactions, particularly myelosuppression. Thiopurine S-methyltransferase (TPMT) and, more recently, Nudix hydrolase 15 (NUDT15) deficiency, due to no-function variants in their respective genes, are well known for their role in the development of this toxicity. Two novel genetic variants, rs12199316 in TPMT and rs73189762 in the NUDT15 gene, were recently identified by targeted sequencing. The latter is particularly interesting because of its potential association with 6-MP intolerance. Here, we assessed the relationship of this variant with the risk of myelosuppression and 6-MP dose intensity in 275 patients treated with Dana Farber Cancer Institute ALL protocols at the Sainte Justine University Health Center. Carriers of the NUDT15 rs73189762 variant allele were at a higher risk of myelosuppression, as shown by absolute phagocyte count reduction during consolidation II and maintenance phases of therapy. Reduction in 6-MP dose intensity was observed in patients with both rs73189762 and known no-function variants in the NUDT15 and TPMT genes. This finding supports the initial observation and suggests that 6-MP dose reduction might be beneficial for individuals with this genotype combination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,761
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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