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Enregistrement W4396515329 · doi:10.22215/etd/2023-15934

A Portable, Rapid Isothermal Nucleic Acid Amplification System with Integrated Microfluidics for Pandemic Surveillance

2023· dissertation· en· W4396515329 sur OpenAlexafffund
Jake Staples

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensCarleton UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeQueen's UniversityEuropean Commission
Mots-clésLoop-mediated isothermal amplificationMicrofluidicsFootprintDNA extractionSIGNAL (programming language)Nucleic acidComputer scienceReal-time computingComputer hardwareMaterials scienceElectronic engineeringNanotechnologyDNAEngineeringPolymerase chain reactionChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Integration of small-footprint cost-effective isothermal rapid DNA extraction, amplication, and detection systems is crucial to achieving a point-of-care pathogen detection system suitable for resource-limited locations.The herein system measures low-level uorescent signals in real-time during nucleic acid amplication, while maintaining the desired assay temperature on a low-power, portable footprint.A thermally stable microuidic device was implemented to mitigate thermocapillary effects and facilitate optical alignment for automated image capture and signal analysis.The system uses Loop-Mediated Isothermal Amplication with primers sensitive to broad strains and lineages of SARS-CoV-2 with viral loads corresponding to cycle thresholds in the range of 16 to 39.Among the 54 samples tested through optimizations, the platform yielded an 84% true positive rate.Preliminary investigations were conducted on developing an electromagnetic extraction process by printing a conductive coil around a microuidic channel.The extraction module was designed to be integrated with the detection system into a sample-to-results point-of-care system.I would like to thank Professor Ravi Prakash for his invaluable advice, help, and support as a supervisor throughout my graduate studies.The work achieved would not have been possible without his vision and expertise in the vast areas of science and engineering.I am extremely grateful to have been able to work on this high-impact project that has given me the experience to continue

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,587
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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