A Portable, Rapid Isothermal Nucleic Acid Amplification System with Integrated Microfluidics for Pandemic Surveillance
Notice bibliographique
Résumé
Integration of small-footprint cost-effective isothermal rapid DNA extraction, amplication, and detection systems is crucial to achieving a point-of-care pathogen detection system suitable for resource-limited locations.The herein system measures low-level uorescent signals in real-time during nucleic acid amplication, while maintaining the desired assay temperature on a low-power, portable footprint.A thermally stable microuidic device was implemented to mitigate thermocapillary effects and facilitate optical alignment for automated image capture and signal analysis.The system uses Loop-Mediated Isothermal Amplication with primers sensitive to broad strains and lineages of SARS-CoV-2 with viral loads corresponding to cycle thresholds in the range of 16 to 39.Among the 54 samples tested through optimizations, the platform yielded an 84% true positive rate.Preliminary investigations were conducted on developing an electromagnetic extraction process by printing a conductive coil around a microuidic channel.The extraction module was designed to be integrated with the detection system into a sample-to-results point-of-care system.I would like to thank Professor Ravi Prakash for his invaluable advice, help, and support as a supervisor throughout my graduate studies.The work achieved would not have been possible without his vision and expertise in the vast areas of science and engineering.I am extremely grateful to have been able to work on this high-impact project that has given me the experience to continue
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».