Evaluation of the utility and cost of secondary confirmatory testing for Neisseria gonorrhoeae identification from culture
Notice bibliographique
Résumé
Current guideline recommends the use of two identification methods for Neisseria gonorrhoeae. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF) is now used for primary identification and may be sufficient for definitive identification of N. gonorrhoeae. The performance of three secondary tests (BactiCard, RapID NH and NET test) were compared using 45 bacterial isolates, including 37 Neisseria species. These secondary tests demonstrated diminished specificity (67% - 88%) for N. gonorrhoeae compared with MALDI-TOF. Additionally, data from six clinical microbiology laboratories was used to compare confirmatory test costs and the agreement of results with MALDI-TOF. Discrepancies were documented for 9.4% of isolates, though all isolates (n= 288) identified by MALDI-TOF as N. gonorrhoeae were confirmed by the reference laboratory. These data demonstrate that MALDI-TOF alone is sufficient for N. gonorrhoeae identification, as secondary did not add diagnostic value but do add costs to the testing process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».