MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4396829471 · doi:10.1101/2024.05.10.24307057

Mapping the distribution and describing the first cases from an ongoing outbreak of a New Strain of mpox in South Kivu, Eastern Democratic Republic of Congo between September 2023 to April 2024

2024· preprint· en· W4396829471 sur OpenAlexaff
David F. Nieuwenhuijse, Pacifique Ndishimye, Jean Claude Udahemuka, Bilembo Kitwanda Steeven, Nzigire Barhatwira Gisèle, Jean Pierre Musabyimana, B. Daniel, Théophile Kiluba Wa Kiluba, Franklin Kumbana Mweshi, Polepole Ngabo, Theophile Tambala, Mazambi Mambo Divin, B Chance, Léandre Mutimbwa Mambo, Leonard Schuele, Justin Bengehya Mbiribindi, Gustavo Sganzerla Martinez, David J. Kelvin, Gaston Lubambo Maboko, Bas B. Oude Munnink, Trudie Lang, Frank M. Aarestrup, Christian Gortázar, Marion Koopmans, Freddy Belesi Siangoli

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOutbreakDemocracyGeographyDistribution (mathematics)Strain (injury)Political scienceCartographyVirologyPoliticsMathematicsMedicineLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background In September 2023, an outbreak of mpox was reported in the eastern part, South Kivu Province, of Democratic Republic of the Congo. This paper aims to provide a summary from several ongoing and completed studies to share initial insights into the time trend and spatial distribution, the links we have observed between level of mpox cases with population density and the presence of professional sex workers (PSW) in bars within affected heath areas of Kamituga health zone. We also seek to share our initial observations on the novel characteristics of this new and emergent strain. Methods Consenting patients admitted with mpox-like symptoms to the Kamituga hospital were recruited to an observational cohort study to understand the clinical characteristics and household perceptions and treatment seeking behaviours. We mapped the demographic and clinical characteristics of all individuals between September 2023 and April 2024. Findings 371 (suspected) mpox cases were admitted to the Kamituga hospital. There were slightly more female than male cases (192/371 [52%] versus 179/371, [48%], and cases were reported from 15 health areas. The majority of cases were reported in Mero (115/371 [31%]), followed by Kimbangu (65/371[18%]), Kabukungu (63/371[17%]), Asuku (47/371 [13%]), Soluluyu (19/371 [5,12%]), Katunga (17/371 [4,58%]), Kalingi, Poudriere (12/371 [3,23%]) respectively, and Poly Afia (7/371 [1,89%]). During this period, 4 deaths occurred and 4 out of 8 women who were pregnant had fetal loss . Three healthcare workers acquired infection when caring for patients. In depth case ascertainment showed that 88,4 % of patients reported recent visits to bars for (professional) sexual interactions as a likely source of infection. Our findings suggest that the epidemic in South Kivu is driven by transmission in a network of professional sex workers, working in bars. The continued spread of the mpox virus in Kamituga health zone and other health zones of South -Kivu points at a critical need for cross border surveillance, and the potential for rapid vaccination of sex workers as potential intervention. Interpretation These data suggest that the rapid transmission of mpox virus is related to interactions with professional sex workers (PSW) in bars within densely populated health areas. The expanding number of cases and the recent spillover to 16 other nearby health zones of South -Kivu including a health district bordering Rwanda and Burundi stresses the need for cross border surveillance. In addition, enhanced response action is needed, including vaccination health education programmes to limit further escalation and stop this outbreak.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetPoxvirus research and outbreaksTravaux en français237 207