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Enregistrement W4396994563 · doi:10.1681/asn.20213210s142b

Identification of Molecularly Distinct Sub-Phenotypes in AKI and Association with Long-Term Clinical Outcomes

2021· article· en· W4396994563 sur OpenAlexaff
Pavan K. Bhatraju, David K. Prince, Sherry G. Mansour, T. Alp İkizler, Edward D. Siew, Amit X. Garg, Alan S. Go, James S. Kaufman, Paul L. Kimmel, Steven G. Coca, Chirag R. Parikh, Mark M. Wurfel, Jonathan Himmelfarb

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdentification (biology)Association (psychology)PhenotypeTerm (time)MedicineComputational biologyBiologyGeneticsGenePsychologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: AKI is a heterogeneous clinical syndrome with varying causes, pathophysiology and diverse clinical outcomes; however, staging AKI by serum creatinine does not fully capture underlying patient heterogeneity. Our goal was to identify AKI sub-phenotypes more tightly linked to underlying pathophysiology and long-term clinical outcomes. Methods: We independently applied latent class analysis (LCA) and k-Means clustering to 29 clinical, plasma and urinary biomarker data measured during hospitalization to identify AKI sub-phenotypes in the ASSESS-AKI study. AKI subphenotype associations were examined with the composite of major adverse kidney events (MAKE), defined as incident or progressive chronic kidney disease, long-term dialysis, or all-cause death during study follow-up. Results: Among 769 AKI patients both LCA and k-Means clustering identified two AKI sub-phenotypes. Class 1 was characterized by a higher prevalence of prior congestive heart failure and favorable blood inflammatory and urinary tubular injury biomarkers, while class 2 was characterized by higher rates of prior chronic kidney disease and less favorable biomarkers. After a median follow-up of 4.7 years, the risk for MAKE was higher with class 2 (HR 1.41; 95% CI, 1.08 to 1.84) compared with class 1 adjusting for demographics, hospital level factors and KDIGO Stage of AKI. The higher risk of MAKE among class 2 was explained by a higher risk of chronic kidney disease progression and dialysis (Figure 1). Conclusions: In this analysis, we identify two molecularly distinct AKI subphenotypes with differing risk of long-term outcomes, independent of current criteria to risk stratify AKI. Future identification of AKI sub-phenotypes may facilitate linking therapies to underlying pathophysiology to prevent long-term sequalae after AKI. Funding: NIDDK SupportFigure 1a.: 29 different continuous vanables used in clustering analyses by AKI sub-phenotypes. Indivual continuous variables were placed on a z scale with a mean of zero and standard deviation of one. Variables are presented from top to bottom in order of maximum separation between class 1 and 2.Figure 1b.: Kaplan-Meier curves for major adverse kidney events (MAKE), CKD incidence, CKD progression, dialysis and death by AKI sub-phenotypes

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,221

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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