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Enregistrement W4397022047 · doi:10.1093/aje/kwae071

Validation of algorithms in studies based on routinely collected health data: general principles

2024· article· en· W4397022047 sur OpenAlexaff
Véra Ehrenstein, Maja Hellfritzsch, Johnny Kahlert, Sinéad Langan, Hisashi Urushihara, Danica Marinac‐Dabic, Jennifer L. Lund, Henrik Toft Sørensen, Eric I. Benchimol

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Epidemiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesGaldermaNational Institutes of HealthAarhus UniversitetRegion MidtjyllandSanofi
Mots-clésComputer scienceOperationalizationExternal validityData miningTerminologyAlgorithmContext (archaeology)CovariateData scienceManagement scienceMachine learningStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinicians, researchers, regulators, and other decision-makers increasingly rely on evidence from real-world data (RWD), including data routinely accumulating in health and administrative databases. RWD studies often rely on algorithms to operationalize variable definitions. An algorithm is a combination of codes or concepts used to identify persons with a specific health condition or characteristic. Establishing the validity of algorithms is a prerequisite for generating valid study findings that can ultimately inform evidence-based health care. In this paper, we aim to systematize terminology, methods, and practical considerations relevant to the conduct of validation studies of RWD-based algorithms. We discuss measures of algorithm accuracy, gold/reference standards, study size, prioritization of accuracy measures, algorithm portability, and implications for interpretation. Information bias is common in epidemiologic studies, underscoring the importance of transparency in decisions regarding choice and prioritizing measures of algorithm validity. The validity of an algorithm should be judged in the context of a data source, and one size does not fit all. Prioritizing validity measures within a given data source depends on the role of a given variable in the analysis (eligibility criterion, exposure, outcome, or covariate). Validation work should be part of routine maintenance of RWD sources. This article is part of a Special Collection on Pharmacoepidemiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,749
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,856
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,7490,856
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,009
Bibliométrie0,0150,011
Études des sciences et des technologies0,0050,033
Communication savante0,0210,016
Science ouverte0,0130,018
Intégrité de la recherche0,0120,014
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,481
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,064 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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