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Enregistrement W4397040385 · doi:10.1681/asn.20233411s1596a

Quantitative Ultrasound for Glomerulosclerosis in Ex Vivo Murine Kidneys

2023· article· en· W4397040385 sur OpenAlexaff
Rohit Singla, Yasmine Lau, Michael R. Hughes, Ricky Hu, Yicong Li, Maziar Riazy, Mei Lin Z. Bissonnette, Kelly M. McNagny, Robert Rohling, Christopher Nguan

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal and Vascular Pathologies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEx vivoGlomerulosclerosisMedicineUltrasoundUrologyPathologyFocal segmental glomerulosclerosisKidney diseaseIn vivoInternal medicineKidneyGlomerulonephritisProteinuriaBiologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) is a condition that can lead to kidney function loss over time, making early detection and diagnosis essential for effective treatment and management. The glomeruli are the main source of ultrasound scattering in the kidney. This study proposes a novel approach to detecting FSGS using a multi-parametric quantitative ultrasound (QUS) approach in ex-vivo murine kidney models. QUS analyzes the spectral content of radiofrequency data in ultrasound to provide user- and system-independent quantifiable measurements, such as backscatter. We hypothesize that as FSGS progresses, there is a measurable increase in backscatter. Methods: Five mice were recruited to each cohort of a podocalyxin knockout (PKO) model, a puromycin aminonucleoside (PAN) model and healthy controls. QUS was performed using a 128-element linear transducer at 15.625 MHz. From radiofrequency data, we extracted 16 parameters. To avoid overfitting, principal component analysis was used to create a reduced set of three parameters. These were inputs to a support vector machine for multi-class classification using a 5-fold cross validation scheme. Histopathologic analysis, performed by two expert pathologists, was used to determine the burden of FSGS as the ground truth. Results: The average PKO case had 7% global segmental glomerulosclerosis and 19% FSGS, while the average PAN case had 20% global segmental glomerulosclerosis, 17% FSGS, and 7% total inflammation. Across all spatial locations or views, no significant differences in QUS parameters were found within a cohort. The mean classification accuracy was 80% across the three groups, with the mean precision, recall, and F1 scores being 0.86, 0.80, and 0.78, respectively. Misclassification only occurred in three PKO cases that were considered normal by the algorithm. The Nakagami scale parameter showed significant differences between the PAN model and the others, while the shape parameter showed significant differences between the PKO model and the others. Conclusions: This study demonstrates that ultrasound measurements alone can effectively discriminate between healthy and diseased models of FSGS in mice. The results provide a foundation for further research into the quantification of kidney disease burden and its eventual use in humans. Funding: Government Support - Non-U.S.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,938
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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