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Enregistrement W4397044085 · doi:10.1681/asn.20233411s1118a

Comparative Effects of Cyclosporine and Voclosporin on Primary Human Proximal Tubular Epithelial Cell (PTEC) Gene Expression

2023· article· en· W4397044085 sur OpenAlexaff
Theresa Aliwarga, Linda M. Rehaume, Catherine K. Yeung, Jonathan Himmelfarb, Edward J. Kelly

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensAurinia (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene expressionGenePrimary (astronomy)BiologyMedicineCancer researchCell biologyPathologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The development of calcineurin inhibitors (CNIs) dramatically changed the face of transplantation, with the majority of solid organ transplant patients prescribed CNI-based therapeutics. Cyclosporine, a CNI that complexes with cyclophilin to competitively inhibit calcineurin phosphatase activity, has significant side effects with chronic nephrotoxicity the primary clinical concern. Cyclosporine related toxic effects include glomerulosclerosis, thrombotic microangiopathy and tubular vacuolization. Voclosporin, a recently approved CNI for treating adults with active lupus nephritis on a background of immunosuppression, is structurally similar to cyclosporine, with improved binding to calcineurin, higher potency and better tolerability. Methods: To compare the tubular effects of these two CNIs, we exposed cultures of primary human PTEC in either standard 2D tissue culture or when grown in a 3D kidney microphysiological system (MPS). Results: Exposure to increasing concentrations (0-10 μM) of cyclosporine or voclosporin [HJ1] revealed only minimal toxicity after 48 hr. in 2D culture. Similarly, exposure of MPS to 10 μM voclosporin or cyclosporine for 48 hr. did not significantly increase KIM-1, a urinary biomarker of acute kidney injury, in MPS effluents. To further differentiate these two CNIs, we performed bulk RNAseq analysis from the MPS studies and observed 443 differentially-expressed genes in the cyclosporine-treated MPS versus 45 genes in the voclosporin cohort. Biological process gene ontology analysis revealed 26 significant pathways in the cyclosporine group and none in the voclosporin group with the majority related to cell cycle processes. PTEC were labeled with a GFP-cytochrome C biosensor to monitor mitochondrial responses. Treatment with either CNI at 1 μM for 48 hr. revealed no changes whereas treatment with 10 μM of either CNI resulted in modest changes in mitochondria as measured by signal intensity and complexity of the network. Conclusions: Ongoing studies include longer term CNI exposures and effects of CYP3A5 genotype as this enzyme is polymorphic, expressed in the kidney and produces isozyme-specific metabolites of cyclosporine. Our results to date support differential effects of voclosporin versus cyclosporine on PTEC gene expression. Funding: Other NIH Support - NCATS, Commercial Support - Aurinia Pharmaceuticals

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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