Draft genome sequence data on Bacillus safensis U41 isolated from soils of Santiniketan, India
Notice bibliographique
Résumé
The draft genome sequence of an isolate of Bacillus safensis U41 from the soils of Santiniketan (23040’12” N and 87039’52” E) is reported here. Bacillus safensis is a bacterium that produces cellulases which is essential for the breakdown of plant biomass. As such, it is a valuable source of digestive enzymes from plant biomass, especially cellulases. The genomic DNA was extracted from a single colony using a QIAgen Blood and Tissue kit (QIAgen Inc., Canada). Sequencing was performed via Illumina HiSeq X using 2 × 150 paired-end chemistry, generating 7,352,576 reads with sequence coverage of 509x. The assembly produced 20 contigs over 200 base pairs (bp) in length, with an N50 value of 901304 and an L50 of 2. The genome size was 3,732,407 bp, and the average GC content was 41.43 %. Genome annotation and gene predictions were performed using Prokka v.1.14.6, which identified 3783 coding sequences, 64 tRNA genes, and 3 rRNA genes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».