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Enregistrement W4399006917 · doi:10.1016/j.vaccine.2024.05.052

Bordetella pertussis infection following relaxation of COVID-19 non-pharmaceutical interventions in 2021–2023 in Vancouver metropolitan area, British Columbia, Canada

2024· article· en· W4399006917 sur OpenAlexafffundabout
Frederic Reicherz, Sirui Li, Allison W. Watts, David A. Goldfarb, Pascal M. Lavoie, Bahaa Abu-Raya

Notice bibliographique

RevueVaccine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie UniversityBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesProvincial Health Services AuthorityDeutsche ForschungsgemeinschaftMichael Smith Health Research BCDalhousie UniversityBC Children’s Hospital Foundation
Mots-clésBordetella pertussisMetropolitan areaCoronavirus disease 2019 (COVID-19)2019-20 coronavirus outbreakWhooping coughSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyPsychological interventionMedicineBiologyInfectious disease (medical specialty)BacteriaOutbreakVaccinationInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: We recently reported a near disappearance of B. pertussis and a decline in anti-B. pertussis antibodies during the peak implementation of Coronavirus disease 2019 (COVID-19) non-pharmaceutical interventions (NPI) in 2021 in British Columbia (BC), Canada. During 2021-2023, incidence of reported B. pertussis cases remained low in BC at < 1/100,000 population. This study determined how serological evidence of B. pertussis changed after the gradual relaxation of NPI between 2021-2023. METHODS: Randomly selected blood samples from school staff 25-51 years old (n = 65) were collected yearly between 2021-2023 in the Vancouver metropolitan area, BC, Canada, and tested for anti-pertussis toxin (PT) IgG levels. Serological evidence of B. pertussis infection (thereafter "seroconversion") was defined as a quantifiable anti-PT IgG levels in subjects with anti-PT IgG levels below lower limit of quantification in the preceding year or a > 4-fold increase in anti-PT IgG levels between two subsequent years. Samples were also tested for anti-diphtheria toxoid (DT) IgG, and similar seroconversion criteria were applied to exclude seroconversion due to vaccination with tetanus-diphtheria-acellular-pertussis (Tdap). RESULTS: Three subjects met seroconversion criteria for anti-PT IgG between 2021 and 2022 and 9 between 2022 and 2023, yielding a seroconversion rate of 4.6 /100 person-years and 14.9/100 person-years, P = 0.127, respectively. None of the subjects met the criteria for vaccination with Tdap. The geometric mean concentration of anti-PT IgG showed a statistically significant decrease in 2022 compared with 2021, 4.8 IU/mL IU/ml (95 % confidence interval [CI], 3.8-5.9) vs. 6.4 IU/ml (95 % CI, 4.9-8.2; p = 0.001), followed by a statistically significant increase in 2023 compared with 2022 6.5 IU/ml (95 % CI, 4.9-8.5) vs. 4.8 IU/ml (95 % CI, 3.8-5.9; p = 0.0006), respectively. DISCUSSION: Serological evidence of B. pertussis increased between 2022 and 2023 despite low reported cases, which suggests that B. pertussis circulation resumed after relaxing of COVID-19 NPI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0050,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentnon

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