Tandem mass spectrometry of homologous 3‐hydroxyfurazan and nitrile amino acids: Analysis of cooperative interactions and fragmentation processes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The assignment of structure by tandem mass spectrometry (MS/MS) relies on the interpretation of the fragmentation behavior of gas‐phase ions. Mass spectra were acquired for a series of heterocyclic mimetics of acidic amino acids and a related series of nitrile amino acids. All amino acids were readily protonated or deprotonated by electrospray ionization (ESI), and distinctive fragmentation processes were observed when the ions were subjected to collision‐induced dissociation (CID). The deprotonated heterocycles showed bond cleavages of the 3‐hydroxyfurazan ring with formation of oxoisocyanate and the complementary deprotonated nitrile amino acid. Further fragmentation of the deprotonated nitrile amino acids was greatly dependent on the length of the alkyl nitrile side chain. Competing losses of CO 2 versus HCN occurred from α‐cyanoglycinate (shortest chain), whereas water was lost from 2‐amino‐5‐cyanopentanoate (longest chain). Interestingly, loss of acrylonitrile by a McLafferty‐type fragmentation process was detected for 2‐amino‐4‐cyanobutanoate, and several competing processes were observed for β‐cyanoalanate. In one process, cyanide ion was formed either by consecutive losses of ammonia, carbon dioxide, and acetylene or by a one‐step decarboxylative elimination. In another, complementary ions were obtained from β‐cyanoalanate by loss of acetonitrile or HN=CHCO 2 H. Fragmentation of the protonated 3‐hydroxyfurazan and nitrile amino acids resulted in the cumulative loss (H 2 O + CO), a loss that is commonly observed for protonated aliphatic α‐amino acids. Overall, the distinct fragmentation behavior of the multifunctional 3‐hydroxyfurazan amino acids correlated with the charged site, whereas fragmentations of the deprotonated nitrile amino acids showed cooperative interactions between the nitrile and the carboxylate groups.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».