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Enregistrement W4399021672 · doi:10.1002/1878-0261.13658

Spliceosomic dysregulation in pancreatic cancer uncovers splicing factors <scp>PRPF8</scp> and <scp>RBMX</scp> as novel candidate actionable targets

2024· article· en· W4399021672 sur OpenAlexaff
Emilia Alors‐Pérez, Ricardo Blázquez‐Encinas, María Trinidad Moreno-Montilla, Víctor García‐Vioque, Juan M. Jiménez‐Vacas, Andrea Mafficini, Iranzu González‐Borja, Claudio Luchini, Juan Manuel Sánchez‐Hidalgo, Marina Sánchez‐Frías, Sergio Pedraza‐Arévalo, Antonio Romero‐Ruíz, Rita T. Lawlor, A. Viúdez, Manuel D. Gahete, Aldo Scarpa, Álvaro Arjona‐Sánchez, Raúl M. Luque, Alejandro Ibáñez‐Costa, Justo P. Castaño

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesEuropean Social FundAgencia Estatal de InvestigaciónInstituto de Salud Carlos IIICentro de Investigación Biomédica en Red-Fisiopatología de la Obesidad y NutriciónMinistero dell'Università e della RicercaInnovative Research Group Project of the National Natural Science Foundation of ChinaUniversità degli Studi di VeronaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroJunta de AndalucíaEuropean Cooperation in Science and TechnologyMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaFondazione Cassa di Risparmio di Verona Vicenza Belluno e AnconaFondazione Italiana per la ricerca sulle Malattie del PancreasMinisterio de Ciencia e InnovaciónEuropean Regional Development FundEuropean CommissionFundación Eugenio Rodríguez Pascual
Mots-clésPancreatic cancerRNA splicingBiologyAlternative splicingGeneticsComputational biologyCancer researchCancerBioinformaticsGeneExon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly lethal cancer, characterized by late diagnosis and poor treatment response. Surgery is the only curative approach, only available to early-diagnosed patients. Current therapies have limited effects, cause severe toxicities, and minimally improve overall survival. Understanding of splicing machinery alterations in PDAC remains incomplete. Here, we comprehensively examined 59 splicing machinery components, uncovering dysregulation in pre-mRNA processing factor 8 (PRPF8) and RNA-binding motif protein X-linked (RBMX). Their downregulated expression was linked to poor prognosis and malignancy features, including tumor stage, invasion and metastasis, and associated with poorer survival and the mutation of key PDAC genes. Experimental modulation of these splicing factors in pancreatic cancer cell lines reverted their expression to non-tumor levels and resulted in decreased key tumor-related features. These results provide evidence that the splicing machinery is altered in PDAC, wherein PRPF8 and RBMX emerge as candidate actionable therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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