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Enregistrement W4399025646 · doi:10.1016/j.ajoint.2024.100034

The association between endophthalmitis risk following a variety of intra-ocular procedures and defensin gene profile

2024· article· en· W4399025646 sur OpenAlexafffundabout
Jonathan C. Park, Angela Zhang, Stefan DeGeus, Michael Hogden, A Churchill, Niels Crama, Anneke Den Hollander, Wai-Ching Lam, Peter J. Kertes, Robert G. Devenyi, Peng Yan, Efrem D. Mandelcorn, Tina Felfeli, David Steel, Richard P. Haynes

Notice bibliographique

RevueAJO International · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOcular Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreHealth Sciences CentreUniversity of British ColumbiaToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesBayer CanadaUniversity of TorontoSight Research UKUniversity of ManitobaBayer
Mots-clésEndophthalmitisDefensinMedicineAssociation (psychology)GeneOphthalmologyBiologyGeneticsPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endophthalmitis is a sight threatening complication of intra-ocular procedures. It has been suggested that a predisposition to endophthalmitis is linked to a specific genotype in the human beta-defensin 1 (HBD-1) gene when previously analysed in a small UK cohort undergoing cataract surgery. We sought to test out this hypothesis in a larger international case: control study (centres in UK, Netherlands and Canada) following a variety of intraocular procedures. International case: control study 660 individuals undergoing an intraocular procedure were recruited (165 cases of endophthalmitis and 495 controls). DNA was extracted. Single nucleotide polymorphisms, SNPs, rs11362, rs1800972 and rs2702877 in the HBD-1 gene were analysed (both individual genotypes and haplotypes were obtained). No associations were found when individual SNPs were analysed across the combined international cohort. However, analysis of the Toronto sub-cohort, showed a statistically significant association between the endophthalmitis cohort and the rs1800972 C allele (OR: 3.18, CI: 1.32 - 7.68, p = 0.01) and rs2702877 G allele (OR: 3.06, CI: 1.35 - 6.95, p = 0.017). No haplotype association was identified with endophthalmitis compared to control in both institution sub-cohorts and combined cohort analysis. A strong trend associating the rs1800972, rs11362 GG mini-haplotype with culture positive endophthalmitis groups across all groups was noted, but this did not reach statistical significance. This is the first study to demonstrate a genetic link between a certain genetic profile (HBD-1 gene SNP variation) and endophthalmitis. Future pre-operative genetic testing could help identify patients at risk of endophthalmitis to guide invasive treatment options.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,194

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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