MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4399281323 · doi:10.1200/jco.2024.42.16_suppl.10012

Access for adolescents and young adults with hard-to-cure cancer to PROFYLE: The pan-Canadian precision oncology pipeline.

2024· article· en· W4399281323 sur OpenAlexaffabout
Lesleigh S. Abbott, Stephanie A. Grover, Jan‐Willem Henning, Sapna Oberoi, David Malkin

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChildhood Cancer Survivors' Quality of Life
Établissements canadiensCancerCare ManitobaHospital for Sick ChildrenChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyPrecision oncologyInternal medicinePrecision medicineCancerPipeline (software)Pathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

10012 Background: Cancer is the most common cause of disease-related death in children, adolescents and young adults (CAYA). Approximately, 1.5% of patients with cancer in Canada are adolescents and young adults (AYAs) (age 15-29). AYAs often present with advanced disease and limited access to clinical trials including genomic testing. The PRecision Oncology For Young peopLE (PROFYLE) national, collaborative program, was created to provide equitable access to molecular profiling to identify novel targeted treatment options for CAYA with hard-to-cure cancers. The AYA node of PROFYLE aims to enhance the inclusion of AYAs across Canada at pediatric and adult centers while raising awareness of improving cancer outcomes of this underserved population. Methods: Building upon 3 pre-existing regional precision oncology programs, PROFYLE was implemented as the first pan-Canadian precision oncology pipeline. The PROFYLE study is multi-centred, non-randomized, interventional, and qualitative. Inclusion criteria: ≤29y; treatment at a Canadian center; diagnosis of a hard-to-cure cancer. It includes genomic and transcriptomic sequencing of paired germline and cancer fresh/frozen samples. Actionable findings, potential targeted therapy options including available clinical trials, clarification of diagnosis, and genetic counseling recommendations are provided to the clinical care team. Results: To date, > 1,200 CAYA are included from all provinces. Of these, 33% were AYAs. Cancer diagnoses included: 47% sarcoma, 15% leukemia/lymphoma, 13% CNS tumor, 25% other. Of the AYAs enrolled, 53% had ≥1 significant tumour profiling finding (48% specific mutations/fusions; 6% DNA repair defect signature, hypermutation, microsatellite instability, chromosomal instability; 3% predictors of therapeutic resistance; 5% outliers in gene expression). 71% had potentially useful findings (15% diagnostic; 9% prognostic; 59% therapeutic; 2% etiologic; 15% cancer predisposition; 2% secondary germline; 0.5% pharmacogenetic). 23% had a pathogenic/likely pathogenic germline variant. 60% had ≥1 potentially actionable somatic alteration. 64% of clinicians indicated that molecular findings impacted clinical management (12% diagnostic; 6% prognostic, 60% therapeutic; 16% germline genetic). 24% indicated a change in treatment planning in response to these findings. Conclusions: The goal of developing a national precision oncology pipeline that provides equitable access to molecular profiling in a clinically relevant timeframe has been realized through the establishment of PROFYLE. Findings demonstrate that the sequencing platform provided medically informative results in the majority of enrolled AYAs. The success of PROFYLE underscores the importance of the continuing efforts to increase the access to this precision oncology initiative for all AYAs with cancer in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,945
Score d'incertitude au seuil0,398

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0050,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,506
Écart entre enseignants0,369 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetChildhood Cancer Survivors' Quality of Life→Travaux en français237 207→