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Enregistrement W4399359365 · doi:10.1038/s41588-024-01763-1

Genome-wide meta-analyses of restless legs syndrome yield insights into genetic architecture, disease biology and risk prediction

2024· review· en· W4399359365 sur OpenAlexafffund
Barbara Schormair, Chen Zhao, Steven Bell, Maria Didriksen, Muhammad Sulaman Nawaz, Nathalie Schandra, Ambra Stefani, Birgit Högl, Yves Dauvilliers, Cornelius G. Bachmann, David Kemlink, Karel Šonka, Walter Paulus, Claudia Trenkwalder, Wolfgang H. Oertel, Magdolna Hornyak, Maris Teder‐Laving, Andres Metspalu, Georgios M. Hadjigeorgiou, Olli Polo, Ingo Fietze, Owen A. Ross, Zbigniew K. Wszołek, Abubaker Ibrahim, Melanie Bergmann, Volker Kittke, Philip Harrer, Joseph Dowsett, Sofiène Chenini, Sisse Rye Ostrowski, Erik Sørensen, Christian Erikstrup, Ole Birger Pedersen, Mie Topholm Bruun, Kaspar René Nielsen, Adam S. Butterworth, Nicole Soranzo, Willem H. Ouwehand, David J. Roberts, John Danesh, Brendan Burchell, Nicholas A. Furlotte, Priyanka Nandakumar, Amélie Bonnefond, Louis Potier, Christopher J. Earley, William G. Ondo, Lan Xiong, Alex Désautels, Markus Perola, Pavel Vodička, Christian Dina, Monika Stoll, André Franke, Wolfgang Lieb, Alexandre F.R. Stewart, Svati H. Shah, Christian Gieger, Annette Peters, David B. Rye, Guy A. Rouleau, Klaus Berger, Hreinn Stefánsson, Henrik Ullum, David A. Hinds, Emanuele Di Angelantonio, Konrad Oexle, Juliane Winkelmann

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRestless Legs Syndrome Research
Établissements canadiensCanadian Heart Research CentreUniversity of OttawaUniversité de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de MontréalMcGill UniversityCanadian Sleep & Circadian NetworkMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNIHR Cambridge Biomedical Research CentreLeibniz-GemeinschaftScience and Technology Facilities CouncilEconomic and Social Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNIHR BioResourceDanmarks Frie ForskningsfondDell EMCDeutsche ForschungsgemeinschaftHealth and Social Care Research and Development DivisionNovo NordiskPublic Health AgencyEngineering and Physical Sciences Research CouncilUniversity of ThessalyEuropean CommissionMedical Research CouncilDepartment of Health and Social CareEuropean Regional Development FundBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on AgingNHS Blood and TransplantNational Institute for Health and Care ResearchHeart and Stroke Foundation of CanadaNovo Nordisk FondenNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBritish Heart FoundationUniversity of CambridgeWellcome TrustCancer Research UKHelmholtz Zentrum MünchenWestfälische Wilhelms-Universität MünsterEmory UniversityChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateScottish GovernmentNational Institutes of HealthUniverzita Karlova v PrazeRestless Legs Syndrome Foundation
Mots-clésBiologyMendelian randomizationGenome-wide association studyGenetic architectureDiseaseLocus (genetics)Genetics1000 Genomes ProjectDrug repositioningRestless legs syndromeEpistasisBioinformaticsComputational biologyGeneQuantitative trait locusDrugInternal medicineGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGenetic variantsMedicineNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Restless legs syndrome (RLS) affects up to 10% of older adults. Their healthcare is impeded by delayed diagnosis and insufficient treatment. To advance disease prediction and find new entry points for therapy, we performed meta-analyses of genome-wide association studies in 116,647 individuals with RLS (cases) and 1,546,466 controls of European ancestry. The pooled analysis increased the number of risk loci eightfold to 164, including three on chromosome X. Sex-specific meta-analyses revealed largely overlapping genetic predispositions of the sexes ( r g = 0.96). Locus annotation prioritized druggable genes such as glutamate receptors 1 and 4, and Mendelian randomization indicated RLS as a causal risk factor for diabetes. Machine learning approaches combining genetic and nongenetic information performed best in risk prediction (area under the curve (AUC) = 0.82–0.91). In summary, we identified targets for drug development and repurposing, prioritized potential causal relationships between RLS and relevant comorbidities and risk factors for follow-up and provided evidence that nonlinear interactions are likely relevant to RLS risk prediction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,010
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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