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Enregistrement W4399535331 · doi:10.1038/s41467-024-49211-2

Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight

2024· article· en· W4399535331 sur OpenAlex
JangKeun Kim, Braden Tierney, Eliah Overbey, Ezequiel Dantas, Matías Fuentealba, Jiwoon Park, S Narayanan, Fei Wu, Deena Najjar, Christopher R. Chin, Cem Meydan, Conor Loy, Begüm Aydoğan Mathyk, Rémi Klotz, Veronica Ortiz, Khiem Nguyen, Krista Ryon, Namita Damle, Nadia Houerbi, Laura Pătraș, Nathan Schanzer, Gwyneth A. Hutchinson, Jonathan Foox, Chandrima Bhattacharya, Matthew MacKay, Evan E. Afshin, Jeremy Wain Hirschberg, Ashley S. Kleinman, Julian C. Schmidt, Caleb M. Schmidt, Michael A. Schmidt, Afshin Beheshti, Irina Matei, David Lyden, Sean Mullane, Amran K. Asadi, Joan Sesing Lenz, Omary Mzava, Min Yu, Saravanan Ganesan, Iwijn De Vlaminck, Ari Melnick, Darko Barišić, Daniel A. Winer, Sara R. Zwart, Brian Crucian, Scott M. Smith, Jaime Mateus, David Furman, Christopher E. Mason

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpaceflight effects on biology
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Research Foundation of KoreaNuclear Safety and Security CommissionNational Research FoundationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesWorldQuant FoundationStop CancerNational Aeronautics and Space Administration
Mots-clésSpaceflightCrewImmune systemBiologyCellCell typeHuman spaceflightComputational biologyGeneticsAeronauticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spaceflight induces an immune response in astronauts. To better characterize this effect, we generated single-cell, multi-ome, cell-free RNA (cfRNA), biochemical, and hematology data for the SpaceX Inspiration4 (I4) mission crew. We found that 18 cytokines/chemokines related to inflammation, aging, and muscle homeostasis changed after spaceflight. In I4 single-cell multi-omics data, we identified a "spaceflight signature" of gene expression characterized by enrichment in oxidative phosphorylation, UV response, immune function, and TCF21 pathways. We confirmed the presence of this signature in independent datasets, including the NASA Twins Study, the I4 skin spatial transcriptomics, and 817 NASA GeneLab mouse transcriptomes. Finally, we observed that (1) T cells showed an up-regulation of FOXP3, (2) MHC class I genes exhibited long-term suppression, and (3) infection-related immune pathways were associated with microbiome shifts. In summary, this study reveals conserved and distinct immune disruptions occurring and details a roadmap for potential countermeasures to preserve astronaut health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle