MDB-63. AN INTERNATIONAL META-ANALYSIS OF SHH MEDULLOBLASTOMA SUBTYPES DEFINES A CLINICALLY SIGNIFICANT HIGH-RISK VARIANT OF SHH-SUBTYPE 3
Notice bibliographique
Résumé
Abstract BACKGROUND The distinction of MBSHH into four methylation-dependent subgroups was recognized by the WHO in 2021. However, these subgroups have not previously been defined by international experimental consensus and their clinico-molecular features and behavior have not formally been investigated in large cohorts. We aimed to robustly identify SHH subgroups through analysis of MBSHH with DNA-methylation profiling. METHODS A cohort of 683 MBSHH, confidently classified using the Heidelberg classifier v12.5, was assembled for analysis from multiple international studies. To define subgroups, we applied consensus sampling-based clustering approaches to tumor methylomes, including assessment of confidence in class-definition and inter-technique concordance. The clinico-molecular features of consensus subgroups were investigated. RESULTS Lowest complexity analysis supported the division of MBSHH into the 4 WHO-subtypes. SHH-1 and SHH-2 were associated with lower age and infrequent mutations of PTCH1/SUFU; SHH-2 was distinguished from SHH-1 by enriched MBEN histology, absence of chromosome 2 gain, less frequent metastasis and more favorable overall-survival. SHH-4 presented in older children and adults (3-57; median 24 years), and was primarily defined by mutations in U1-snRNA (67/72). Consensus analyses supported the division of SHH-subgroup-3 into three. Importantly, the SHH-3C subtype was associated with a coalescence of high-risk features (LCA histology, TP53mut, MYCNamp/GLI2amp) alongside 3p, 10q and 17p loss, and had dismal survival. The remaining SHH-3A/B subtypes were characterized by 9q loss, frequent focal amplifications of TERT and PPM1D, and equivalent better survival. CONCLUSIONS This study affirms the distinction of MBSHH into 4 major subgroups. For infant disease, SHH-2 is a favorable-risk marker. For childhood-MBSHH, the SHH-3C subtype provides a molecular definition of high-risk that subsumes other previously-defined high-risk disease markers (LCA, MYCNamp, TP53mut) into a unified high-risk disease group. The other SHH-3 subtypes behave similarly and are favorable-risk. These subtypes have potential to enhance molecularly-guided risk-stratification in routine diagnostics, to improve patient outcomes and quality-of-life.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,009 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».