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Enregistrement W4399970144 · doi:10.1016/j.stem.2024.05.010

Selective advantage of mutant stem cells in human clonal hematopoiesis is associated with attenuated response to inflammation and aging

2024· article· en· W4399970144 sur OpenAlex
Niels Asger Jakobsen, Sven Turkalj, Andy G.X. Zeng, Bilyana Stoilova, Marlen Metzner, Susann Rahmig, Murtaza S. Nagree, Sayyam Shah, Rachel Moore, Batchimeg Usukhbayar, Mirian Angulo Salazar, Grigore Gafencu, Alison Kennedy, Simon Newman, Benjamin Kendrick, Adrian Taylor, Rasheed Afinowi-Luitz, Roger Gundle, Bridget Watkins, Kim Wheway, Debra Beazley, Alex Murison, Alicia G. Aguilar-Navarro, Eugenia Flores‐Figueroa, Stephanie G. Dakin, Andrew Carr, Claus Nerlov, John E. Dick, Stephanie Z. Xie, Paresh Vyas

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCell stem cell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesRadcliffe Department of Medicine, University of OxfordCanadian Institutes of Health ResearchManchester Biomedical Research CentreBlood Cancer UKClarendon FundMedical Research CouncilVersus ArthritisNational Research Council CanadaUniversity of TorontoCanadian Cancer Society Research InstituteCanada First Research Excellence FundCanada Research ChairsInternational Development Research CentreTerry Fox FoundationUniversity of OxfordCanadian Cancer SocietyNational Institute for Health and Care ResearchGovernment of OntarioPrincess Margaret Cancer FoundationPfizerNIHR Oxford Biomedical Research CentreOntario Institute for Cancer ResearchMinistry of Health, Ontario
Mots-clésBiologyHaematopoiesisMutantStem cellTranscriptomeInflammationMyeloidCell biologyProgenitor cellBone marrowMutationHematopoietic stem cellSomatic cellGeneticsImmunologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clonal hematopoiesis (CH) arises when hematopoietic stem cells (HSCs) acquire mutations, most frequently in the DNMT3A and TET2 genes, conferring a competitive advantage through mechanisms that remain unclear. To gain insight into how CH mutations enable gradual clonal expansion, we used single-cell multi-omics with high-fidelity genotyping on human CH bone marrow (BM) samples. Most of the selective advantage of mutant cells occurs within HSCs. DNMT3A- and TET2-mutant clones expand further in early progenitors, while TET2 mutations accelerate myeloid maturation in a dose-dependent manner. Unexpectedly, both mutant and non-mutant HSCs from CH samples are enriched for inflammatory and aging transcriptomic signatures, compared with HSCs from non-CH samples, revealing a non-cell-autonomous effect. However, DNMT3A- and TET2-mutant HSCs have an attenuated inflammatory response relative to wild-type HSCs within the same sample. Our data support a model whereby CH clones are gradually selected because they are resistant to the deleterious impact of inflammation and aging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,815

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle